Protein–RNA interactions for Protein: O60547

GMDS, GDP-mannose 4,6 dehydratase, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GMDSO60547 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
GMDSO60547 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
GMDSO60547 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
GMDSO60547 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
GMDSO60547 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
GMDSO60547 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
GMDSO60547 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
GMDSO60547 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
GMDSO60547 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
GMDSO60547 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
GMDSO60547 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
GMDSO60547 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
GMDSO60547 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
GMDSO60547 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
GMDSO60547 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
GMDSO60547 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
GMDSO60547 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
GMDSO60547 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
GMDSO60547 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
GMDSO60547 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
GMDSO60547 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
GMDSO60547 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
GMDSO60547 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
GMDSO60547 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
GMDSO60547 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
GMDSO60547 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
GMDSO60547 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
GMDSO60547 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
GMDSO60547 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
GMDSO60547 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
GMDSO60547 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
GMDSO60547 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
GMDSO60547 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
GMDSO60547 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
GMDSO60547 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
GMDSO60547 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
GMDSO60547 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
GMDSO60547 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
GMDSO60547 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
GMDSO60547 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
GMDSO60547 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
GMDSO60547 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
GMDSO60547 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
GMDSO60547 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
GMDSO60547 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
GMDSO60547 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
GMDSO60547 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
GMDSO60547 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
GMDSO60547 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
GMDSO60547 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
GMDSO60547 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
GMDSO60547 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
GMDSO60547 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
GMDSO60547 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
GMDSO60547 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
GMDSO60547 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
GMDSO60547 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
GMDSO60547 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
GMDSO60547 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
GMDSO60547 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
GMDSO60547 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
GMDSO60547 ASF1A-201ENST00000229595 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
GMDSO60547 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
GMDSO60547 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
GMDSO60547 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
GMDSO60547 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
GMDSO60547 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
GMDSO60547 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
GMDSO60547 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
GMDSO60547 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
GMDSO60547 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
GMDSO60547 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
GMDSO60547 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
GMDSO60547 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
GMDSO60547 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
GMDSO60547 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
GMDSO60547 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
GMDSO60547 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
GMDSO60547 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
GMDSO60547 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
GMDSO60547 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
GMDSO60547 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
GMDSO60547 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
GMDSO60547 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
GMDSO60547 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
GMDSO60547 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
GMDSO60547 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
GMDSO60547 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
GMDSO60547 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
GMDSO60547 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
GMDSO60547 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
GMDSO60547 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
GMDSO60547 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
GMDSO60547 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
GMDSO60547 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
GMDSO60547 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
GMDSO60547 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
GMDSO60547 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
GMDSO60547 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
GMDSO60547 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms