Protein–RNA interactions for Protein: O43490

PROM1, Prominin-1, humanhuman

Predictions only

Length 865 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PROM1O43490 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
PROM1O43490 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PROM1O43490 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
PROM1O43490 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
PROM1O43490 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
PROM1O43490 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
PROM1O43490 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
PROM1O43490 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PROM1O43490 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
PROM1O43490 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PROM1O43490 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PROM1O43490 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PROM1O43490 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PROM1O43490 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PROM1O43490 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PROM1O43490 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PROM1O43490 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
PROM1O43490 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PROM1O43490 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PROM1O43490 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PROM1O43490 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PROM1O43490 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PROM1O43490 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PROM1O43490 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
PROM1O43490 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PROM1O43490 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PROM1O43490 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PROM1O43490 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
PROM1O43490 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PROM1O43490 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PROM1O43490 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PROM1O43490 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PROM1O43490 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PROM1O43490 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PROM1O43490 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PROM1O43490 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PROM1O43490 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PROM1O43490 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
PROM1O43490 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PROM1O43490 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
PROM1O43490 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PROM1O43490 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PROM1O43490 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PROM1O43490 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PROM1O43490 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PROM1O43490 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PROM1O43490 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
PROM1O43490 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PROM1O43490 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PROM1O43490 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PROM1O43490 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PROM1O43490 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PROM1O43490 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PROM1O43490 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PROM1O43490 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PROM1O43490 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PROM1O43490 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PROM1O43490 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PROM1O43490 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PROM1O43490 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PROM1O43490 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
PROM1O43490 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PROM1O43490 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PROM1O43490 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PROM1O43490 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PROM1O43490 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PROM1O43490 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PROM1O43490 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PROM1O43490 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PROM1O43490 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PROM1O43490 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PROM1O43490 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PROM1O43490 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PROM1O43490 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PROM1O43490 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PROM1O43490 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PROM1O43490 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PROM1O43490 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PROM1O43490 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PROM1O43490 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PROM1O43490 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PROM1O43490 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PROM1O43490 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PROM1O43490 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PROM1O43490 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PROM1O43490 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PROM1O43490 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PROM1O43490 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PROM1O43490 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PROM1O43490 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PROM1O43490 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PROM1O43490 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PROM1O43490 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PROM1O43490 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PROM1O43490 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PROM1O43490 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PROM1O43490 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PROM1O43490 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PROM1O43490 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PROM1O43490 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms