Protein–RNA interactions for Protein: O15205

UBD, Ubiquitin D, humanhuman

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBDO15205 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
UBDO15205 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
UBDO15205 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
UBDO15205 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
UBDO15205 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
UBDO15205 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
UBDO15205 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
UBDO15205 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
UBDO15205 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
UBDO15205 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
UBDO15205 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
UBDO15205 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
UBDO15205 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
UBDO15205 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
UBDO15205 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
UBDO15205 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
UBDO15205 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
UBDO15205 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
UBDO15205 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
UBDO15205 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
UBDO15205 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
UBDO15205 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
UBDO15205 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
UBDO15205 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
UBDO15205 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
UBDO15205 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
UBDO15205 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
UBDO15205 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
UBDO15205 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
UBDO15205 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
UBDO15205 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
UBDO15205 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
UBDO15205 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
UBDO15205 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
UBDO15205 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
UBDO15205 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
UBDO15205 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
UBDO15205 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
UBDO15205 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
UBDO15205 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
UBDO15205 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
UBDO15205 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
UBDO15205 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
UBDO15205 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
UBDO15205 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
UBDO15205 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
UBDO15205 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
UBDO15205 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
UBDO15205 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
UBDO15205 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
UBDO15205 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
UBDO15205 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
UBDO15205 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
UBDO15205 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
UBDO15205 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
UBDO15205 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
UBDO15205 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
UBDO15205 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
UBDO15205 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
UBDO15205 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
UBDO15205 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
UBDO15205 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
UBDO15205 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
UBDO15205 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
UBDO15205 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
UBDO15205 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
UBDO15205 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
UBDO15205 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
UBDO15205 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
UBDO15205 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
UBDO15205 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
UBDO15205 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
UBDO15205 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
UBDO15205 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
UBDO15205 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
UBDO15205 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
UBDO15205 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
UBDO15205 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
UBDO15205 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
UBDO15205 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
UBDO15205 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
UBDO15205 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
UBDO15205 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
UBDO15205 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
UBDO15205 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
UBDO15205 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
UBDO15205 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
UBDO15205 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
UBDO15205 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
UBDO15205 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
UBDO15205 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
UBDO15205 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
UBDO15205 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
UBDO15205 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
UBDO15205 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
UBDO15205 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
UBDO15205 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
UBDO15205 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
UBDO15205 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
UBDO15205 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms