Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPP1

PHF8, Histone lysine demethylase PHF8, humanhuman

Predictions only

Length 1,060 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF8Q9UPP1 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PHF8Q9UPP1 IL32-232ENST00000552356 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PHF8Q9UPP1 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PHF8Q9UPP1 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PHF8Q9UPP1 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PHF8Q9UPP1 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PHF8Q9UPP1 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PHF8Q9UPP1 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PHF8Q9UPP1 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PHF8Q9UPP1 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PHF8Q9UPP1 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC22.52■■□□□ 1.19
PHF8Q9UPP1 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
PHF8Q9UPP1 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PHF8Q9UPP1 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PHF8Q9UPP1 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PHF8Q9UPP1 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PHF8Q9UPP1 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PHF8Q9UPP1 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PHF8Q9UPP1 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
PHF8Q9UPP1 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PHF8Q9UPP1 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PHF8Q9UPP1 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PHF8Q9UPP1 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PHF8Q9UPP1 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PHF8Q9UPP1 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PHF8Q9UPP1 PRAF2-201ENST00000376386 801 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PHF8Q9UPP1 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PHF8Q9UPP1 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PHF8Q9UPP1 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PHF8Q9UPP1 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PHF8Q9UPP1 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PHF8Q9UPP1 Z94721.1-201ENST00000444102 385 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PHF8Q9UPP1 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PHF8Q9UPP1 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PHF8Q9UPP1 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PHF8Q9UPP1 AL033527.4-201ENST00000641026 673 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
PHF8Q9UPP1 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PHF8Q9UPP1 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PHF8Q9UPP1 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PHF8Q9UPP1 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PHF8Q9UPP1 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PHF8Q9UPP1 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PHF8Q9UPP1 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PHF8Q9UPP1 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PHF8Q9UPP1 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PHF8Q9UPP1 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PHF8Q9UPP1 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PHF8Q9UPP1 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PHF8Q9UPP1 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PHF8Q9UPP1 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PHF8Q9UPP1 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PHF8Q9UPP1 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PHF8Q9UPP1 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PHF8Q9UPP1 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PHF8Q9UPP1 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PHF8Q9UPP1 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PHF8Q9UPP1 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PHF8Q9UPP1 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PHF8Q9UPP1 ROPN1-207ENST00000484329 566 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PHF8Q9UPP1 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PHF8Q9UPP1 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PHF8Q9UPP1 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PHF8Q9UPP1 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PHF8Q9UPP1 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PHF8Q9UPP1 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PHF8Q9UPP1 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PHF8Q9UPP1 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
PHF8Q9UPP1 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PHF8Q9UPP1 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PHF8Q9UPP1 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PHF8Q9UPP1 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PHF8Q9UPP1 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PHF8Q9UPP1 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PHF8Q9UPP1 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PHF8Q9UPP1 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PHF8Q9UPP1 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PHF8Q9UPP1 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PHF8Q9UPP1 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PHF8Q9UPP1 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
PHF8Q9UPP1 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PHF8Q9UPP1 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PHF8Q9UPP1 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PHF8Q9UPP1 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PHF8Q9UPP1 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PHF8Q9UPP1 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PHF8Q9UPP1 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PHF8Q9UPP1 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PHF8Q9UPP1 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PHF8Q9UPP1 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PHF8Q9UPP1 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PHF8Q9UPP1 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PHF8Q9UPP1 AL606495.2-201ENST00000605867 535 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
PHF8Q9UPP1 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
PHF8Q9UPP1 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PHF8Q9UPP1 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PHF8Q9UPP1 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PHF8Q9UPP1 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PHF8Q9UPP1 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PHF8Q9UPP1 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PHF8Q9UPP1 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms