Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBS0

RPS6KB2, Ribosomal protein S6 kinase beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 482 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KB2Q9UBS0 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RPS6KB2Q9UBS0 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RPS6KB2Q9UBS0 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RPS6KB2Q9UBS0 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RPS6KB2Q9UBS0 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RPS6KB2Q9UBS0 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RPS6KB2Q9UBS0 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RPS6KB2Q9UBS0 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RPS6KB2Q9UBS0 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RPS6KB2Q9UBS0 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RPS6KB2Q9UBS0 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RPS6KB2Q9UBS0 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RPS6KB2Q9UBS0 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RPS6KB2Q9UBS0 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RPS6KB2Q9UBS0 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RPS6KB2Q9UBS0 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RPS6KB2Q9UBS0 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RPS6KB2Q9UBS0 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RPS6KB2Q9UBS0 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RPS6KB2Q9UBS0 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RPS6KB2Q9UBS0 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RPS6KB2Q9UBS0 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RPS6KB2Q9UBS0 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RPS6KB2Q9UBS0 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RPS6KB2Q9UBS0 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RPS6KB2Q9UBS0 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RPS6KB2Q9UBS0 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RPS6KB2Q9UBS0 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RPS6KB2Q9UBS0 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RPS6KB2Q9UBS0 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RPS6KB2Q9UBS0 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RPS6KB2Q9UBS0 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RPS6KB2Q9UBS0 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RPS6KB2Q9UBS0 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RPS6KB2Q9UBS0 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RPS6KB2Q9UBS0 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RPS6KB2Q9UBS0 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RPS6KB2Q9UBS0 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RPS6KB2Q9UBS0 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RPS6KB2Q9UBS0 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RPS6KB2Q9UBS0 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RPS6KB2Q9UBS0 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RPS6KB2Q9UBS0 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RPS6KB2Q9UBS0 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RPS6KB2Q9UBS0 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RPS6KB2Q9UBS0 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RPS6KB2Q9UBS0 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RPS6KB2Q9UBS0 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RPS6KB2Q9UBS0 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
RPS6KB2Q9UBS0 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RPS6KB2Q9UBS0 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RPS6KB2Q9UBS0 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RPS6KB2Q9UBS0 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
RPS6KB2Q9UBS0 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RPS6KB2Q9UBS0 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RPS6KB2Q9UBS0 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
RPS6KB2Q9UBS0 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RPS6KB2Q9UBS0 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RPS6KB2Q9UBS0 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RPS6KB2Q9UBS0 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RPS6KB2Q9UBS0 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RPS6KB2Q9UBS0 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RPS6KB2Q9UBS0 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RPS6KB2Q9UBS0 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RPS6KB2Q9UBS0 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
RPS6KB2Q9UBS0 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RPS6KB2Q9UBS0 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
RPS6KB2Q9UBS0 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RPS6KB2Q9UBS0 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RPS6KB2Q9UBS0 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RPS6KB2Q9UBS0 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RPS6KB2Q9UBS0 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RPS6KB2Q9UBS0 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RPS6KB2Q9UBS0 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RPS6KB2Q9UBS0 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RPS6KB2Q9UBS0 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RPS6KB2Q9UBS0 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RPS6KB2Q9UBS0 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RPS6KB2Q9UBS0 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RPS6KB2Q9UBS0 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RPS6KB2Q9UBS0 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RPS6KB2Q9UBS0 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RPS6KB2Q9UBS0 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RPS6KB2Q9UBS0 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RPS6KB2Q9UBS0 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RPS6KB2Q9UBS0 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RPS6KB2Q9UBS0 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RPS6KB2Q9UBS0 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RPS6KB2Q9UBS0 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
RPS6KB2Q9UBS0 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RPS6KB2Q9UBS0 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RPS6KB2Q9UBS0 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RPS6KB2Q9UBS0 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RPS6KB2Q9UBS0 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RPS6KB2Q9UBS0 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RPS6KB2Q9UBS0 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RPS6KB2Q9UBS0 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RPS6KB2Q9UBS0 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RPS6KB2Q9UBS0 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RPS6KB2Q9UBS0 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.6 ms