Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYR8

RDH8, Retinol dehydrogenase 8, humanhuman

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Length 311 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RDH8Q9NYR8 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RDH8Q9NYR8 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
RDH8Q9NYR8 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RDH8Q9NYR8 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RDH8Q9NYR8 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RDH8Q9NYR8 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RDH8Q9NYR8 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
RDH8Q9NYR8 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
RDH8Q9NYR8 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
RDH8Q9NYR8 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
RDH8Q9NYR8 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RDH8Q9NYR8 ITSN1-210ENST00000399353 3913 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RDH8Q9NYR8 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
RDH8Q9NYR8 PSD2-201ENST00000274710 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RDH8Q9NYR8 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
RDH8Q9NYR8 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RDH8Q9NYR8 SLC43A2-201ENST00000301335 8136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RDH8Q9NYR8 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RDH8Q9NYR8 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
RDH8Q9NYR8 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
RDH8Q9NYR8 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RDH8Q9NYR8 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
RDH8Q9NYR8 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
RDH8Q9NYR8 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
RDH8Q9NYR8 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
RDH8Q9NYR8 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
RDH8Q9NYR8 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
RDH8Q9NYR8 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC14.56□□□□□ -0.08
RDH8Q9NYR8 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RDH8Q9NYR8 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RDH8Q9NYR8 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
RDH8Q9NYR8 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RDH8Q9NYR8 CICP4-201ENST00000447359 2812 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
RDH8Q9NYR8 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RDH8Q9NYR8 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
RDH8Q9NYR8 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RDH8Q9NYR8 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
RDH8Q9NYR8 SPAG9-222ENST00000618113 8246 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
RDH8Q9NYR8 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
RDH8Q9NYR8 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RDH8Q9NYR8 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RDH8Q9NYR8 MYH6-201ENST00000356287 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RDH8Q9NYR8 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RDH8Q9NYR8 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
RDH8Q9NYR8 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
RDH8Q9NYR8 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
RDH8Q9NYR8 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RDH8Q9NYR8 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RDH8Q9NYR8 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RDH8Q9NYR8 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RDH8Q9NYR8 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
RDH8Q9NYR8 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
RDH8Q9NYR8 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RDH8Q9NYR8 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
RDH8Q9NYR8 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
RDH8Q9NYR8 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
RDH8Q9NYR8 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
RDH8Q9NYR8 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
RDH8Q9NYR8 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RDH8Q9NYR8 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RDH8Q9NYR8 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RDH8Q9NYR8 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
RDH8Q9NYR8 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RDH8Q9NYR8 AC114490.1-201ENST00000417456 3163 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
RDH8Q9NYR8 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RDH8Q9NYR8 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RDH8Q9NYR8 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
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RDH8Q9NYR8 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RDH8Q9NYR8 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RDH8Q9NYR8 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RDH8Q9NYR8 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
RDH8Q9NYR8 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RDH8Q9NYR8 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
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RDH8Q9NYR8 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
RDH8Q9NYR8 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RDH8Q9NYR8 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RDH8Q9NYR8 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RDH8Q9NYR8 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RDH8Q9NYR8 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
RDH8Q9NYR8 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
RDH8Q9NYR8 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RDH8Q9NYR8 SFI1-209ENST00000443011 3579 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
RDH8Q9NYR8 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RDH8Q9NYR8 LMX1B-201ENST00000355497 5809 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RDH8Q9NYR8 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
RDH8Q9NYR8 ZNF516-201ENST00000443185 8118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RDH8Q9NYR8 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
RDH8Q9NYR8 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RDH8Q9NYR8 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RDH8Q9NYR8 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RDH8Q9NYR8 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RDH8Q9NYR8 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
RDH8Q9NYR8 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
RDH8Q9NYR8 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
RDH8Q9NYR8 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
RDH8Q9NYR8 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
RDH8Q9NYR8 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
RDH8Q9NYR8 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
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