Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY66

KDM5D, Lysine-specific demethylase 5D, humanhuman

Predictions only

Length 1,539 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM5DQ9BY66 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
KDM5DQ9BY66 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
KDM5DQ9BY66 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
KDM5DQ9BY66 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
KDM5DQ9BY66 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
KDM5DQ9BY66 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
KDM5DQ9BY66 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
KDM5DQ9BY66 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
KDM5DQ9BY66 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
KDM5DQ9BY66 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
KDM5DQ9BY66 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
KDM5DQ9BY66 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
KDM5DQ9BY66 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
KDM5DQ9BY66 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
KDM5DQ9BY66 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
KDM5DQ9BY66 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
KDM5DQ9BY66 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
KDM5DQ9BY66 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
KDM5DQ9BY66 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
KDM5DQ9BY66 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
KDM5DQ9BY66 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
KDM5DQ9BY66 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
KDM5DQ9BY66 ZDHHC4-203ENST00000396707 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
KDM5DQ9BY66 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
KDM5DQ9BY66 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
KDM5DQ9BY66 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
KDM5DQ9BY66 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
KDM5DQ9BY66 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
KDM5DQ9BY66 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
KDM5DQ9BY66 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
KDM5DQ9BY66 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
KDM5DQ9BY66 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
KDM5DQ9BY66 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
KDM5DQ9BY66 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
KDM5DQ9BY66 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
KDM5DQ9BY66 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
KDM5DQ9BY66 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
KDM5DQ9BY66 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
KDM5DQ9BY66 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
KDM5DQ9BY66 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
KDM5DQ9BY66 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
KDM5DQ9BY66 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
KDM5DQ9BY66 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
KDM5DQ9BY66 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
KDM5DQ9BY66 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC24.33■■□□□ 1.49
KDM5DQ9BY66 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
KDM5DQ9BY66 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
KDM5DQ9BY66 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
KDM5DQ9BY66 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
KDM5DQ9BY66 MIR6799-201ENST00000620297 69 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
KDM5DQ9BY66 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
KDM5DQ9BY66 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
KDM5DQ9BY66 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
KDM5DQ9BY66 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
KDM5DQ9BY66 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
KDM5DQ9BY66 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
KDM5DQ9BY66 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
KDM5DQ9BY66 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
KDM5DQ9BY66 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
KDM5DQ9BY66 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
KDM5DQ9BY66 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
KDM5DQ9BY66 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
KDM5DQ9BY66 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
KDM5DQ9BY66 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
KDM5DQ9BY66 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
KDM5DQ9BY66 VAMP4-202ENST00000367740 1193 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
KDM5DQ9BY66 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
KDM5DQ9BY66 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
KDM5DQ9BY66 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
KDM5DQ9BY66 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
KDM5DQ9BY66 NAA38-206ENST00000576384 424 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
KDM5DQ9BY66 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC24.32■■□□□ 1.48
KDM5DQ9BY66 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC24.32■■□□□ 1.48
KDM5DQ9BY66 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
KDM5DQ9BY66 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
KDM5DQ9BY66 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
KDM5DQ9BY66 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
KDM5DQ9BY66 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.32■■□□□ 1.48
KDM5DQ9BY66 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
KDM5DQ9BY66 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
KDM5DQ9BY66 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
KDM5DQ9BY66 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
KDM5DQ9BY66 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
KDM5DQ9BY66 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
KDM5DQ9BY66 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
KDM5DQ9BY66 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
KDM5DQ9BY66 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
KDM5DQ9BY66 ZNF589-204ENST00000440261 917 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
KDM5DQ9BY66 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
KDM5DQ9BY66 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
KDM5DQ9BY66 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
KDM5DQ9BY66 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
KDM5DQ9BY66 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
KDM5DQ9BY66 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
KDM5DQ9BY66 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
KDM5DQ9BY66 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
KDM5DQ9BY66 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
KDM5DQ9BY66 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
KDM5DQ9BY66 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
KDM5DQ9BY66 RABEPK-201ENST00000259460 1313 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms