Protein–RNA interactions for Protein: Q96SJ8

TSPAN18, Tetraspanin-18, humanhuman

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN18Q96SJ8 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TSPAN18Q96SJ8 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TSPAN18Q96SJ8 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TSPAN18Q96SJ8 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TSPAN18Q96SJ8 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TSPAN18Q96SJ8 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
TSPAN18Q96SJ8 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TSPAN18Q96SJ8 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TSPAN18Q96SJ8 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TSPAN18Q96SJ8 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TSPAN18Q96SJ8 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TSPAN18Q96SJ8 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TSPAN18Q96SJ8 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TSPAN18Q96SJ8 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TSPAN18Q96SJ8 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TSPAN18Q96SJ8 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TSPAN18Q96SJ8 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TSPAN18Q96SJ8 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TSPAN18Q96SJ8 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TSPAN18Q96SJ8 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
TSPAN18Q96SJ8 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TSPAN18Q96SJ8 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TSPAN18Q96SJ8 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TSPAN18Q96SJ8 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TSPAN18Q96SJ8 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TSPAN18Q96SJ8 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TSPAN18Q96SJ8 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TSPAN18Q96SJ8 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TSPAN18Q96SJ8 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TSPAN18Q96SJ8 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TSPAN18Q96SJ8 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TSPAN18Q96SJ8 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TSPAN18Q96SJ8 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TSPAN18Q96SJ8 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TSPAN18Q96SJ8 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TSPAN18Q96SJ8 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TSPAN18Q96SJ8 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TSPAN18Q96SJ8 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TSPAN18Q96SJ8 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TSPAN18Q96SJ8 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TSPAN18Q96SJ8 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TSPAN18Q96SJ8 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TSPAN18Q96SJ8 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TSPAN18Q96SJ8 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TSPAN18Q96SJ8 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TSPAN18Q96SJ8 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TSPAN18Q96SJ8 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
TSPAN18Q96SJ8 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TSPAN18Q96SJ8 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TSPAN18Q96SJ8 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TSPAN18Q96SJ8 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TSPAN18Q96SJ8 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TSPAN18Q96SJ8 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TSPAN18Q96SJ8 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TSPAN18Q96SJ8 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TSPAN18Q96SJ8 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TSPAN18Q96SJ8 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TSPAN18Q96SJ8 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
TSPAN18Q96SJ8 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TSPAN18Q96SJ8 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TSPAN18Q96SJ8 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
TSPAN18Q96SJ8 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TSPAN18Q96SJ8 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TSPAN18Q96SJ8 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TSPAN18Q96SJ8 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TSPAN18Q96SJ8 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TSPAN18Q96SJ8 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TSPAN18Q96SJ8 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TSPAN18Q96SJ8 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TSPAN18Q96SJ8 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TSPAN18Q96SJ8 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TSPAN18Q96SJ8 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TSPAN18Q96SJ8 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TSPAN18Q96SJ8 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TSPAN18Q96SJ8 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TSPAN18Q96SJ8 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TSPAN18Q96SJ8 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TSPAN18Q96SJ8 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TSPAN18Q96SJ8 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TSPAN18Q96SJ8 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TSPAN18Q96SJ8 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TSPAN18Q96SJ8 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TSPAN18Q96SJ8 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TSPAN18Q96SJ8 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
TSPAN18Q96SJ8 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TSPAN18Q96SJ8 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TSPAN18Q96SJ8 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TSPAN18Q96SJ8 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TSPAN18Q96SJ8 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
TSPAN18Q96SJ8 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TSPAN18Q96SJ8 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TSPAN18Q96SJ8 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TSPAN18Q96SJ8 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TSPAN18Q96SJ8 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TSPAN18Q96SJ8 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TSPAN18Q96SJ8 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TSPAN18Q96SJ8 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TSPAN18Q96SJ8 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TSPAN18Q96SJ8 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
TSPAN18Q96SJ8 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61 ms