Protein–RNA interactions for Protein: Q8TF64

GIPC3, PDZ domain-containing protein GIPC3, humanhuman

Predictions only

Length 312 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GIPC3Q8TF64 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GIPC3Q8TF64 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GIPC3Q8TF64 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GIPC3Q8TF64 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
GIPC3Q8TF64 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GIPC3Q8TF64 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GIPC3Q8TF64 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GIPC3Q8TF64 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GIPC3Q8TF64 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
GIPC3Q8TF64 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GIPC3Q8TF64 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GIPC3Q8TF64 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GIPC3Q8TF64 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GIPC3Q8TF64 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GIPC3Q8TF64 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GIPC3Q8TF64 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GIPC3Q8TF64 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GIPC3Q8TF64 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GIPC3Q8TF64 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GIPC3Q8TF64 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GIPC3Q8TF64 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GIPC3Q8TF64 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GIPC3Q8TF64 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GIPC3Q8TF64 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GIPC3Q8TF64 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
GIPC3Q8TF64 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GIPC3Q8TF64 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GIPC3Q8TF64 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GIPC3Q8TF64 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GIPC3Q8TF64 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
GIPC3Q8TF64 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GIPC3Q8TF64 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GIPC3Q8TF64 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GIPC3Q8TF64 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GIPC3Q8TF64 POLL-206ENST00000370172 2308 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GIPC3Q8TF64 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GIPC3Q8TF64 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GIPC3Q8TF64 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GIPC3Q8TF64 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GIPC3Q8TF64 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GIPC3Q8TF64 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GIPC3Q8TF64 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GIPC3Q8TF64 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GIPC3Q8TF64 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
GIPC3Q8TF64 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GIPC3Q8TF64 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GIPC3Q8TF64 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GIPC3Q8TF64 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GIPC3Q8TF64 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
GIPC3Q8TF64 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GIPC3Q8TF64 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GIPC3Q8TF64 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GIPC3Q8TF64 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GIPC3Q8TF64 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GIPC3Q8TF64 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GIPC3Q8TF64 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GIPC3Q8TF64 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GIPC3Q8TF64 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GIPC3Q8TF64 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GIPC3Q8TF64 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GIPC3Q8TF64 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GIPC3Q8TF64 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GIPC3Q8TF64 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GIPC3Q8TF64 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GIPC3Q8TF64 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
GIPC3Q8TF64 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GIPC3Q8TF64 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GIPC3Q8TF64 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GIPC3Q8TF64 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
GIPC3Q8TF64 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GIPC3Q8TF64 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GIPC3Q8TF64 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
GIPC3Q8TF64 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GIPC3Q8TF64 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GIPC3Q8TF64 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GIPC3Q8TF64 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GIPC3Q8TF64 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GIPC3Q8TF64 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GIPC3Q8TF64 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GIPC3Q8TF64 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GIPC3Q8TF64 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GIPC3Q8TF64 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GIPC3Q8TF64 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GIPC3Q8TF64 FMO5-201ENST00000254090 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GIPC3Q8TF64 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GIPC3Q8TF64 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GIPC3Q8TF64 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GIPC3Q8TF64 PATZ1-203ENST00000351933 3638 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GIPC3Q8TF64 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GIPC3Q8TF64 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GIPC3Q8TF64 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GIPC3Q8TF64 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GIPC3Q8TF64 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GIPC3Q8TF64 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
GIPC3Q8TF64 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GIPC3Q8TF64 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GIPC3Q8TF64 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GIPC3Q8TF64 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GIPC3Q8TF64 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GIPC3Q8TF64 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms