Protein–RNA interactions for Protein: Q8N8Q8

COX18, Mitochondrial inner membrane protein COX18, humanhuman

Predictions only

Length 333 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COX18Q8N8Q8 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
COX18Q8N8Q8 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
COX18Q8N8Q8 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
COX18Q8N8Q8 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
COX18Q8N8Q8 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
COX18Q8N8Q8 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
COX18Q8N8Q8 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
COX18Q8N8Q8 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
COX18Q8N8Q8 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
COX18Q8N8Q8 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
COX18Q8N8Q8 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
COX18Q8N8Q8 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
COX18Q8N8Q8 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
COX18Q8N8Q8 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
COX18Q8N8Q8 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
COX18Q8N8Q8 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
COX18Q8N8Q8 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
COX18Q8N8Q8 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
COX18Q8N8Q8 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
COX18Q8N8Q8 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
COX18Q8N8Q8 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
COX18Q8N8Q8 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
COX18Q8N8Q8 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
COX18Q8N8Q8 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
COX18Q8N8Q8 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
COX18Q8N8Q8 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
COX18Q8N8Q8 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
COX18Q8N8Q8 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
COX18Q8N8Q8 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
COX18Q8N8Q8 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
COX18Q8N8Q8 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
COX18Q8N8Q8 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
COX18Q8N8Q8 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
COX18Q8N8Q8 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
COX18Q8N8Q8 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
COX18Q8N8Q8 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
COX18Q8N8Q8 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
COX18Q8N8Q8 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
COX18Q8N8Q8 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
COX18Q8N8Q8 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
COX18Q8N8Q8 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
COX18Q8N8Q8 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
COX18Q8N8Q8 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
COX18Q8N8Q8 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
COX18Q8N8Q8 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
COX18Q8N8Q8 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
COX18Q8N8Q8 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
COX18Q8N8Q8 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
COX18Q8N8Q8 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
COX18Q8N8Q8 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
COX18Q8N8Q8 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
COX18Q8N8Q8 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
COX18Q8N8Q8 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
COX18Q8N8Q8 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
COX18Q8N8Q8 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
COX18Q8N8Q8 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
COX18Q8N8Q8 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
COX18Q8N8Q8 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
COX18Q8N8Q8 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
COX18Q8N8Q8 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
COX18Q8N8Q8 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
COX18Q8N8Q8 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
COX18Q8N8Q8 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
COX18Q8N8Q8 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
COX18Q8N8Q8 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
COX18Q8N8Q8 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
COX18Q8N8Q8 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
COX18Q8N8Q8 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
COX18Q8N8Q8 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
COX18Q8N8Q8 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
COX18Q8N8Q8 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
COX18Q8N8Q8 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
COX18Q8N8Q8 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
COX18Q8N8Q8 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
COX18Q8N8Q8 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
COX18Q8N8Q8 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
COX18Q8N8Q8 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
COX18Q8N8Q8 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
COX18Q8N8Q8 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
COX18Q8N8Q8 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
COX18Q8N8Q8 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
COX18Q8N8Q8 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
COX18Q8N8Q8 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
COX18Q8N8Q8 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
COX18Q8N8Q8 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
COX18Q8N8Q8 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
COX18Q8N8Q8 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
COX18Q8N8Q8 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
COX18Q8N8Q8 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
COX18Q8N8Q8 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
COX18Q8N8Q8 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
COX18Q8N8Q8 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
COX18Q8N8Q8 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
COX18Q8N8Q8 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
COX18Q8N8Q8 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
COX18Q8N8Q8 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
COX18Q8N8Q8 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
COX18Q8N8Q8 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
COX18Q8N8Q8 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
COX18Q8N8Q8 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 285.7 ms