Protein–RNA interactions for Protein: Q66GS9

CEP135, Centrosomal protein of 135 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 1,140 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP135Q66GS9 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CEP135Q66GS9 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CEP135Q66GS9 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CEP135Q66GS9 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
CEP135Q66GS9 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
CEP135Q66GS9 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
CEP135Q66GS9 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
CEP135Q66GS9 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CEP135Q66GS9 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CEP135Q66GS9 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CEP135Q66GS9 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CEP135Q66GS9 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CEP135Q66GS9 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CEP135Q66GS9 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CEP135Q66GS9 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CEP135Q66GS9 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CEP135Q66GS9 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CEP135Q66GS9 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CEP135Q66GS9 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CEP135Q66GS9 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CEP135Q66GS9 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CEP135Q66GS9 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CEP135Q66GS9 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CEP135Q66GS9 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CEP135Q66GS9 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
CEP135Q66GS9 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CEP135Q66GS9 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CEP135Q66GS9 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CEP135Q66GS9 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CEP135Q66GS9 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CEP135Q66GS9 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CEP135Q66GS9 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CEP135Q66GS9 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CEP135Q66GS9 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CEP135Q66GS9 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CEP135Q66GS9 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CEP135Q66GS9 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CEP135Q66GS9 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CEP135Q66GS9 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CEP135Q66GS9 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CEP135Q66GS9 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CEP135Q66GS9 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CEP135Q66GS9 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CEP135Q66GS9 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CEP135Q66GS9 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
CEP135Q66GS9 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
CEP135Q66GS9 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CEP135Q66GS9 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CEP135Q66GS9 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CEP135Q66GS9 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CEP135Q66GS9 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CEP135Q66GS9 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CEP135Q66GS9 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CEP135Q66GS9 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CEP135Q66GS9 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CEP135Q66GS9 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CEP135Q66GS9 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CEP135Q66GS9 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CEP135Q66GS9 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CEP135Q66GS9 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CEP135Q66GS9 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CEP135Q66GS9 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
CEP135Q66GS9 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CEP135Q66GS9 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CEP135Q66GS9 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CEP135Q66GS9 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CEP135Q66GS9 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CEP135Q66GS9 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CEP135Q66GS9 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CEP135Q66GS9 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CEP135Q66GS9 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CEP135Q66GS9 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CEP135Q66GS9 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CEP135Q66GS9 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
CEP135Q66GS9 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CEP135Q66GS9 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CEP135Q66GS9 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CEP135Q66GS9 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CEP135Q66GS9 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CEP135Q66GS9 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CEP135Q66GS9 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CEP135Q66GS9 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CEP135Q66GS9 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CEP135Q66GS9 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CEP135Q66GS9 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
CEP135Q66GS9 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
CEP135Q66GS9 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CEP135Q66GS9 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CEP135Q66GS9 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CEP135Q66GS9 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CEP135Q66GS9 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CEP135Q66GS9 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CEP135Q66GS9 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CEP135Q66GS9 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CEP135Q66GS9 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CEP135Q66GS9 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CEP135Q66GS9 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CEP135Q66GS9 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CEP135Q66GS9 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CEP135Q66GS9 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms