Protein–RNA interactions for Protein: Q4G0W2

DUSP28, Dual specificity phosphatase 28, humanhuman

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP28Q4G0W2 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
DUSP28Q4G0W2 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
DUSP28Q4G0W2 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
DUSP28Q4G0W2 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
DUSP28Q4G0W2 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
DUSP28Q4G0W2 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
DUSP28Q4G0W2 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
DUSP28Q4G0W2 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
DUSP28Q4G0W2 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
DUSP28Q4G0W2 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
DUSP28Q4G0W2 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
DUSP28Q4G0W2 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
DUSP28Q4G0W2 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
DUSP28Q4G0W2 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
DUSP28Q4G0W2 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
DUSP28Q4G0W2 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
DUSP28Q4G0W2 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
DUSP28Q4G0W2 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
DUSP28Q4G0W2 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
DUSP28Q4G0W2 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
DUSP28Q4G0W2 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
DUSP28Q4G0W2 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
DUSP28Q4G0W2 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
DUSP28Q4G0W2 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
DUSP28Q4G0W2 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
DUSP28Q4G0W2 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
DUSP28Q4G0W2 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
DUSP28Q4G0W2 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
DUSP28Q4G0W2 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
DUSP28Q4G0W2 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
DUSP28Q4G0W2 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
DUSP28Q4G0W2 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
DUSP28Q4G0W2 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
DUSP28Q4G0W2 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
DUSP28Q4G0W2 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
DUSP28Q4G0W2 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
DUSP28Q4G0W2 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
DUSP28Q4G0W2 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
DUSP28Q4G0W2 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
DUSP28Q4G0W2 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
DUSP28Q4G0W2 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
DUSP28Q4G0W2 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
DUSP28Q4G0W2 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
DUSP28Q4G0W2 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
DUSP28Q4G0W2 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
DUSP28Q4G0W2 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
DUSP28Q4G0W2 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
DUSP28Q4G0W2 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
DUSP28Q4G0W2 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
DUSP28Q4G0W2 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
DUSP28Q4G0W2 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
DUSP28Q4G0W2 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
DUSP28Q4G0W2 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
DUSP28Q4G0W2 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
DUSP28Q4G0W2 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
DUSP28Q4G0W2 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
DUSP28Q4G0W2 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
DUSP28Q4G0W2 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
DUSP28Q4G0W2 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
DUSP28Q4G0W2 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
DUSP28Q4G0W2 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
DUSP28Q4G0W2 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
DUSP28Q4G0W2 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
DUSP28Q4G0W2 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
DUSP28Q4G0W2 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
DUSP28Q4G0W2 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
DUSP28Q4G0W2 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
DUSP28Q4G0W2 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
DUSP28Q4G0W2 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
DUSP28Q4G0W2 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
DUSP28Q4G0W2 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
DUSP28Q4G0W2 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
DUSP28Q4G0W2 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
DUSP28Q4G0W2 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
DUSP28Q4G0W2 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
DUSP28Q4G0W2 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
DUSP28Q4G0W2 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
DUSP28Q4G0W2 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
DUSP28Q4G0W2 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
DUSP28Q4G0W2 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
DUSP28Q4G0W2 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
DUSP28Q4G0W2 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
DUSP28Q4G0W2 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
DUSP28Q4G0W2 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
DUSP28Q4G0W2 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
DUSP28Q4G0W2 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
DUSP28Q4G0W2 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
DUSP28Q4G0W2 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
DUSP28Q4G0W2 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
DUSP28Q4G0W2 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
DUSP28Q4G0W2 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
DUSP28Q4G0W2 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
DUSP28Q4G0W2 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
DUSP28Q4G0W2 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
DUSP28Q4G0W2 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
DUSP28Q4G0W2 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
DUSP28Q4G0W2 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
DUSP28Q4G0W2 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
DUSP28Q4G0W2 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
DUSP28Q4G0W2 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms