Protein–RNA interactions for Protein: Q2WGJ6

KLHL38, Kelch-like protein 38, humanhuman

Predictions only

Length 581 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL38Q2WGJ6 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
KLHL38Q2WGJ6 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
KLHL38Q2WGJ6 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
KLHL38Q2WGJ6 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
KLHL38Q2WGJ6 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
KLHL38Q2WGJ6 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
KLHL38Q2WGJ6 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
KLHL38Q2WGJ6 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
KLHL38Q2WGJ6 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
KLHL38Q2WGJ6 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
KLHL38Q2WGJ6 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
KLHL38Q2WGJ6 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
KLHL38Q2WGJ6 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
KLHL38Q2WGJ6 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
KLHL38Q2WGJ6 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
KLHL38Q2WGJ6 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
KLHL38Q2WGJ6 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
KLHL38Q2WGJ6 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
KLHL38Q2WGJ6 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
KLHL38Q2WGJ6 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
KLHL38Q2WGJ6 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
KLHL38Q2WGJ6 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
KLHL38Q2WGJ6 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
KLHL38Q2WGJ6 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
KLHL38Q2WGJ6 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
KLHL38Q2WGJ6 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
KLHL38Q2WGJ6 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
KLHL38Q2WGJ6 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
KLHL38Q2WGJ6 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
KLHL38Q2WGJ6 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
KLHL38Q2WGJ6 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
KLHL38Q2WGJ6 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
KLHL38Q2WGJ6 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
KLHL38Q2WGJ6 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
KLHL38Q2WGJ6 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
KLHL38Q2WGJ6 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
KLHL38Q2WGJ6 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
KLHL38Q2WGJ6 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
KLHL38Q2WGJ6 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
KLHL38Q2WGJ6 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
KLHL38Q2WGJ6 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
KLHL38Q2WGJ6 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
KLHL38Q2WGJ6 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
KLHL38Q2WGJ6 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
KLHL38Q2WGJ6 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
KLHL38Q2WGJ6 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
KLHL38Q2WGJ6 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
KLHL38Q2WGJ6 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
KLHL38Q2WGJ6 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
KLHL38Q2WGJ6 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
KLHL38Q2WGJ6 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
KLHL38Q2WGJ6 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
KLHL38Q2WGJ6 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
KLHL38Q2WGJ6 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
KLHL38Q2WGJ6 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
KLHL38Q2WGJ6 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
KLHL38Q2WGJ6 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
KLHL38Q2WGJ6 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
KLHL38Q2WGJ6 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
KLHL38Q2WGJ6 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
KLHL38Q2WGJ6 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
KLHL38Q2WGJ6 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
KLHL38Q2WGJ6 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
KLHL38Q2WGJ6 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.33
KLHL38Q2WGJ6 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
KLHL38Q2WGJ6 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
KLHL38Q2WGJ6 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
KLHL38Q2WGJ6 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
KLHL38Q2WGJ6 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
KLHL38Q2WGJ6 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
KLHL38Q2WGJ6 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
KLHL38Q2WGJ6 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
KLHL38Q2WGJ6 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
KLHL38Q2WGJ6 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
KLHL38Q2WGJ6 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
KLHL38Q2WGJ6 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
KLHL38Q2WGJ6 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
KLHL38Q2WGJ6 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
KLHL38Q2WGJ6 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
KLHL38Q2WGJ6 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
KLHL38Q2WGJ6 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
KLHL38Q2WGJ6 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
KLHL38Q2WGJ6 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
KLHL38Q2WGJ6 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
KLHL38Q2WGJ6 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
KLHL38Q2WGJ6 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
KLHL38Q2WGJ6 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
KLHL38Q2WGJ6 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
KLHL38Q2WGJ6 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
KLHL38Q2WGJ6 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
KLHL38Q2WGJ6 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
KLHL38Q2WGJ6 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
KLHL38Q2WGJ6 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
KLHL38Q2WGJ6 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
KLHL38Q2WGJ6 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
KLHL38Q2WGJ6 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
KLHL38Q2WGJ6 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
KLHL38Q2WGJ6 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
KLHL38Q2WGJ6 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
KLHL38Q2WGJ6 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms