Protein–RNA interactions for Protein: Q17R55

FAM187B, Protein FAM187B, humanhuman

Predictions only

Length 369 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM187BQ17R55 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
FAM187BQ17R55 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
FAM187BQ17R55 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
FAM187BQ17R55 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
FAM187BQ17R55 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
FAM187BQ17R55 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
FAM187BQ17R55 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
FAM187BQ17R55 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
FAM187BQ17R55 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
FAM187BQ17R55 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
FAM187BQ17R55 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
FAM187BQ17R55 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
FAM187BQ17R55 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
FAM187BQ17R55 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
FAM187BQ17R55 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
FAM187BQ17R55 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
FAM187BQ17R55 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
FAM187BQ17R55 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
FAM187BQ17R55 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
FAM187BQ17R55 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
FAM187BQ17R55 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
FAM187BQ17R55 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
FAM187BQ17R55 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
FAM187BQ17R55 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
FAM187BQ17R55 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
FAM187BQ17R55 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
FAM187BQ17R55 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
FAM187BQ17R55 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
FAM187BQ17R55 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
FAM187BQ17R55 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
FAM187BQ17R55 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
FAM187BQ17R55 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
FAM187BQ17R55 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
FAM187BQ17R55 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
FAM187BQ17R55 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
FAM187BQ17R55 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
FAM187BQ17R55 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
FAM187BQ17R55 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
FAM187BQ17R55 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
FAM187BQ17R55 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
FAM187BQ17R55 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
FAM187BQ17R55 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
FAM187BQ17R55 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
FAM187BQ17R55 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
FAM187BQ17R55 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
FAM187BQ17R55 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
FAM187BQ17R55 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
FAM187BQ17R55 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
FAM187BQ17R55 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
FAM187BQ17R55 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
FAM187BQ17R55 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
FAM187BQ17R55 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
FAM187BQ17R55 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
FAM187BQ17R55 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
FAM187BQ17R55 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
FAM187BQ17R55 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
FAM187BQ17R55 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
FAM187BQ17R55 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
FAM187BQ17R55 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
FAM187BQ17R55 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
FAM187BQ17R55 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
FAM187BQ17R55 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
FAM187BQ17R55 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
FAM187BQ17R55 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
FAM187BQ17R55 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
FAM187BQ17R55 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
FAM187BQ17R55 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
FAM187BQ17R55 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
FAM187BQ17R55 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
FAM187BQ17R55 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
FAM187BQ17R55 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
FAM187BQ17R55 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
FAM187BQ17R55 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
FAM187BQ17R55 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
FAM187BQ17R55 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
FAM187BQ17R55 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
FAM187BQ17R55 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
FAM187BQ17R55 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
FAM187BQ17R55 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
FAM187BQ17R55 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
FAM187BQ17R55 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
FAM187BQ17R55 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
FAM187BQ17R55 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
FAM187BQ17R55 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
FAM187BQ17R55 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
FAM187BQ17R55 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
FAM187BQ17R55 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
FAM187BQ17R55 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
FAM187BQ17R55 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
FAM187BQ17R55 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
FAM187BQ17R55 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
FAM187BQ17R55 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
FAM187BQ17R55 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
FAM187BQ17R55 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
FAM187BQ17R55 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
FAM187BQ17R55 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
FAM187BQ17R55 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
FAM187BQ17R55 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
FAM187BQ17R55 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
FAM187BQ17R55 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.1 ms