Protein–RNA interactions for Protein: Q14162

SCARF1, Scavenger receptor class F member 1, humanhuman

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Length 830 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARF1Q14162 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SCARF1Q14162 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SCARF1Q14162 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SCARF1Q14162 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SCARF1Q14162 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SCARF1Q14162 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SCARF1Q14162 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SCARF1Q14162 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SCARF1Q14162 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SCARF1Q14162 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SCARF1Q14162 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
SCARF1Q14162 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SCARF1Q14162 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SCARF1Q14162 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SCARF1Q14162 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
SCARF1Q14162 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SCARF1Q14162 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SCARF1Q14162 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SCARF1Q14162 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SCARF1Q14162 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SCARF1Q14162 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
SCARF1Q14162 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SCARF1Q14162 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SCARF1Q14162 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SCARF1Q14162 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SCARF1Q14162 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SCARF1Q14162 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SCARF1Q14162 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SCARF1Q14162 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SCARF1Q14162 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SCARF1Q14162 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SCARF1Q14162 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SCARF1Q14162 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SCARF1Q14162 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SCARF1Q14162 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SCARF1Q14162 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SCARF1Q14162 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
SCARF1Q14162 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
SCARF1Q14162 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SCARF1Q14162 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SCARF1Q14162 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SCARF1Q14162 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SCARF1Q14162 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SCARF1Q14162 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SCARF1Q14162 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SCARF1Q14162 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SCARF1Q14162 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SCARF1Q14162 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SCARF1Q14162 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SCARF1Q14162 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SCARF1Q14162 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SCARF1Q14162 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SCARF1Q14162 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SCARF1Q14162 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SCARF1Q14162 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SCARF1Q14162 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SCARF1Q14162 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SCARF1Q14162 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SCARF1Q14162 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SCARF1Q14162 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SCARF1Q14162 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SCARF1Q14162 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
SCARF1Q14162 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SCARF1Q14162 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SCARF1Q14162 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SCARF1Q14162 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SCARF1Q14162 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SCARF1Q14162 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SCARF1Q14162 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SCARF1Q14162 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SCARF1Q14162 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SCARF1Q14162 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SCARF1Q14162 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SCARF1Q14162 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SCARF1Q14162 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SCARF1Q14162 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SCARF1Q14162 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SCARF1Q14162 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SCARF1Q14162 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SCARF1Q14162 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SCARF1Q14162 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SCARF1Q14162 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SCARF1Q14162 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SCARF1Q14162 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SCARF1Q14162 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SCARF1Q14162 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SCARF1Q14162 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SCARF1Q14162 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
SCARF1Q14162 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SCARF1Q14162 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SCARF1Q14162 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SCARF1Q14162 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SCARF1Q14162 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SCARF1Q14162 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SCARF1Q14162 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SCARF1Q14162 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
SCARF1Q14162 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
SCARF1Q14162 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
SCARF1Q14162 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SCARF1Q14162 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
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