Protein–RNA interactions for Protein: Q14031

COL4A6, Collagen alpha-6(IV) chain, humanhuman

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Length 1,691 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL4A6Q14031 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
COL4A6Q14031 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
COL4A6Q14031 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
COL4A6Q14031 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
COL4A6Q14031 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
COL4A6Q14031 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
COL4A6Q14031 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
COL4A6Q14031 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
COL4A6Q14031 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
COL4A6Q14031 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
COL4A6Q14031 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
COL4A6Q14031 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
COL4A6Q14031 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
COL4A6Q14031 AC084346.2-201ENST00000607097 949 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
COL4A6Q14031 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
COL4A6Q14031 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
COL4A6Q14031 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
COL4A6Q14031 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
COL4A6Q14031 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
COL4A6Q14031 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
COL4A6Q14031 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
COL4A6Q14031 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
COL4A6Q14031 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
COL4A6Q14031 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC17.56■□□□□ 0.4
COL4A6Q14031 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
COL4A6Q14031 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
COL4A6Q14031 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
COL4A6Q14031 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
COL4A6Q14031 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
COL4A6Q14031 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
COL4A6Q14031 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
COL4A6Q14031 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
COL4A6Q14031 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC17.55■□□□□ 0.4
COL4A6Q14031 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
COL4A6Q14031 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
COL4A6Q14031 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
COL4A6Q14031 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
COL4A6Q14031 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
COL4A6Q14031 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.55■□□□□ 0.4
COL4A6Q14031 AC105020.3-201ENST00000566036 560 ntTSL 4 BASIC17.55■□□□□ 0.4
COL4A6Q14031 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
COL4A6Q14031 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
COL4A6Q14031 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
COL4A6Q14031 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
COL4A6Q14031 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
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COL4A6Q14031 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
COL4A6Q14031 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
COL4A6Q14031 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
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COL4A6Q14031 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
COL4A6Q14031 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
COL4A6Q14031 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
COL4A6Q14031 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
COL4A6Q14031 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
COL4A6Q14031 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
COL4A6Q14031 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.55■□□□□ 0.4
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COL4A6Q14031 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
COL4A6Q14031 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
COL4A6Q14031 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
COL4A6Q14031 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
COL4A6Q14031 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
COL4A6Q14031 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
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COL4A6Q14031 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
COL4A6Q14031 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
COL4A6Q14031 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
COL4A6Q14031 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
COL4A6Q14031 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
COL4A6Q14031 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
COL4A6Q14031 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
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COL4A6Q14031 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
COL4A6Q14031 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC17.54■□□□□ 0.4
COL4A6Q14031 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
COL4A6Q14031 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
COL4A6Q14031 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
COL4A6Q14031 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
COL4A6Q14031 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
COL4A6Q14031 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
COL4A6Q14031 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
COL4A6Q14031 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
COL4A6Q14031 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
COL4A6Q14031 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
COL4A6Q14031 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
COL4A6Q14031 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
COL4A6Q14031 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
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