Protein–RNA interactions for Protein: Q13310

PABPC4, Polyadenylate-binding protein 4, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 644 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PABPC4Q13310 CALM1-204ENST00000553422 438 ntTSL 35.43□□□□□ -1.547e-27■■□□□ 13.1
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PABPC4Q13310 CSDE1-204ENST00000369530 3774 ntTSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.173e-14■■□□□ 13.1
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PABPC4Q13310 COMMD4-203ENST00000480484 3225 ntTSL 1 (best)10.8□□□□□ -0.681e-6■■□□□ 13.1
PABPC4Q13310 HAX1-202ENST00000435087 822 ntTSL 315.36■□□□□ 0.054e-8■■□□□ 13.1
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PABPC4Q13310 NUP153-201ENST00000262077 5487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.22e-6■■□□□ 13.1
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PABPC4Q13310 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.821e-6■■□□□ 13.1
PABPC4Q13310 STK11-207ENST00000589152 3365 ntTSL 216.67■□□□□ 0.261e-6■■□□□ 13.1
PABPC4Q13310 SEPT5-212ENST00000470814 2353 ntTSL 522.18■■□□□ 1.144e-7■■□□□ 13.1
PABPC4Q13310 PHF1-208ENST00000486845 1099 ntTSL 524.74■■□□□ 1.552e-6■■□□□ 13.1
PABPC4Q13310 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.232e-10■■□□□ 13.1
PABPC4Q13310 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.082e-10■■□□□ 13.1
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PABPC4Q13310 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.722e-6■■□□□ 13.1
PABPC4Q13310 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.562e-6■■□□□ 13.1
PABPC4Q13310 PHF1-204ENST00000427826 862 ntTSL 318.38■□□□□ 0.532e-6■■□□□ 13.1
PABPC4Q13310 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.379e-11■■□□□ 13.1
PABPC4Q13310 DEDD2-203ENST00000593804 1586 ntTSL 223.52■■□□□ 1.369e-11■■□□□ 13.1
PABPC4Q13310 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.099e-11■■□□□ 13.1
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PABPC4Q13310 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.822e-6■■□□□ 13.1
PABPC4Q13310 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.192e-6■■□□□ 13.1
PABPC4Q13310 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.152e-6■■□□□ 13.1
PABPC4Q13310 TMEM41A-202ENST00000382227 541 ntTSL 422.95■■□□□ 1.262e-7■■□□□ 13.1
PABPC4Q13310 TMEM41A-206ENST00000475480 1035 ntTSL 317.25■□□□□ 0.352e-7■■□□□ 13.1
PABPC4Q13310 TMEM41A-203ENST00000421852 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.012e-7■■□□□ 13.1
PABPC4Q13310 PRMT1-211ENST00000528623 543 ntTSL 315.26■□□□□ 0.035e-8■■□□□ 13.1
PABPC4Q13310 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.325e-8■■□□□ 13.1
PABPC4Q13310 RHOT2-212ENST00000564659 854 ntTSL 219.61■□□□□ 0.734e-8■■□□□ 13
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