Protein–RNA interactions for Protein: Q12846

STX4, Syntaxin-4, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STX4Q12846 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
STX4Q12846 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
STX4Q12846 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
STX4Q12846 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
STX4Q12846 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
STX4Q12846 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
STX4Q12846 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
STX4Q12846 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
STX4Q12846 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
STX4Q12846 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
STX4Q12846 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
STX4Q12846 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
STX4Q12846 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
STX4Q12846 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
STX4Q12846 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
STX4Q12846 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
STX4Q12846 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
STX4Q12846 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
STX4Q12846 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
STX4Q12846 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
STX4Q12846 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
STX4Q12846 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
STX4Q12846 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
STX4Q12846 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
STX4Q12846 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
STX4Q12846 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
STX4Q12846 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
STX4Q12846 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
STX4Q12846 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
STX4Q12846 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
STX4Q12846 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
STX4Q12846 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
STX4Q12846 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
STX4Q12846 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
STX4Q12846 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
STX4Q12846 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
STX4Q12846 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
STX4Q12846 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
STX4Q12846 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
STX4Q12846 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
STX4Q12846 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
STX4Q12846 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
STX4Q12846 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
STX4Q12846 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
STX4Q12846 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
STX4Q12846 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
STX4Q12846 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
STX4Q12846 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
STX4Q12846 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
STX4Q12846 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
STX4Q12846 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
STX4Q12846 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
STX4Q12846 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
STX4Q12846 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
STX4Q12846 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
STX4Q12846 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
STX4Q12846 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
STX4Q12846 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
STX4Q12846 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
STX4Q12846 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
STX4Q12846 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
STX4Q12846 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
STX4Q12846 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
STX4Q12846 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
STX4Q12846 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
STX4Q12846 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
STX4Q12846 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
STX4Q12846 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
STX4Q12846 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
STX4Q12846 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
STX4Q12846 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
STX4Q12846 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
STX4Q12846 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
STX4Q12846 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
STX4Q12846 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
STX4Q12846 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
STX4Q12846 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
STX4Q12846 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
STX4Q12846 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
STX4Q12846 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
STX4Q12846 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
STX4Q12846 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
STX4Q12846 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
STX4Q12846 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
STX4Q12846 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
STX4Q12846 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
STX4Q12846 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
STX4Q12846 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
STX4Q12846 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
STX4Q12846 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
STX4Q12846 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
STX4Q12846 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
STX4Q12846 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
STX4Q12846 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
STX4Q12846 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
STX4Q12846 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
STX4Q12846 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
STX4Q12846 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
STX4Q12846 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
STX4Q12846 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
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