Protein–RNA interactions for Protein: P78364

PHC1, Polyhomeotic-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,004 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHC1P78364 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PHC1P78364 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
PHC1P78364 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PHC1P78364 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PHC1P78364 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PHC1P78364 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PHC1P78364 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PHC1P78364 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PHC1P78364 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PHC1P78364 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PHC1P78364 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PHC1P78364 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
PHC1P78364 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PHC1P78364 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PHC1P78364 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PHC1P78364 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PHC1P78364 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PHC1P78364 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PHC1P78364 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PHC1P78364 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PHC1P78364 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PHC1P78364 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PHC1P78364 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PHC1P78364 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PHC1P78364 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PHC1P78364 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PHC1P78364 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PHC1P78364 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PHC1P78364 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PHC1P78364 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PHC1P78364 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PHC1P78364 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PHC1P78364 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PHC1P78364 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PHC1P78364 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PHC1P78364 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PHC1P78364 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PHC1P78364 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PHC1P78364 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PHC1P78364 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PHC1P78364 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PHC1P78364 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PHC1P78364 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PHC1P78364 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PHC1P78364 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PHC1P78364 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PHC1P78364 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PHC1P78364 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PHC1P78364 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PHC1P78364 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PHC1P78364 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PHC1P78364 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PHC1P78364 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PHC1P78364 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PHC1P78364 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PHC1P78364 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PHC1P78364 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PHC1P78364 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PHC1P78364 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PHC1P78364 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PHC1P78364 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PHC1P78364 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PHC1P78364 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PHC1P78364 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PHC1P78364 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PHC1P78364 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PHC1P78364 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PHC1P78364 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PHC1P78364 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PHC1P78364 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PHC1P78364 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PHC1P78364 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
PHC1P78364 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PHC1P78364 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PHC1P78364 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PHC1P78364 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PHC1P78364 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PHC1P78364 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PHC1P78364 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PHC1P78364 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PHC1P78364 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PHC1P78364 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PHC1P78364 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PHC1P78364 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PHC1P78364 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PHC1P78364 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PHC1P78364 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PHC1P78364 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PHC1P78364 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PHC1P78364 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PHC1P78364 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
PHC1P78364 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PHC1P78364 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PHC1P78364 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PHC1P78364 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PHC1P78364 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PHC1P78364 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PHC1P78364 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PHC1P78364 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
PHC1P78364 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms