Protein–RNA interactions for Protein: P61221

ABCE1, ATP-binding cassette sub-family E member 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCE1P61221 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ABCE1P61221 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ABCE1P61221 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ABCE1P61221 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ABCE1P61221 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ABCE1P61221 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ABCE1P61221 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ABCE1P61221 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ABCE1P61221 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ABCE1P61221 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ABCE1P61221 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ABCE1P61221 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ABCE1P61221 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ABCE1P61221 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ABCE1P61221 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ABCE1P61221 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ABCE1P61221 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ABCE1P61221 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ABCE1P61221 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ABCE1P61221 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ABCE1P61221 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ABCE1P61221 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ABCE1P61221 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ABCE1P61221 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ABCE1P61221 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ABCE1P61221 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ABCE1P61221 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ABCE1P61221 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ABCE1P61221 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ABCE1P61221 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ABCE1P61221 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ABCE1P61221 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ABCE1P61221 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ABCE1P61221 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
ABCE1P61221 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ABCE1P61221 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ABCE1P61221 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ABCE1P61221 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ABCE1P61221 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ABCE1P61221 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ABCE1P61221 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ABCE1P61221 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ABCE1P61221 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ABCE1P61221 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ABCE1P61221 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ABCE1P61221 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ABCE1P61221 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ABCE1P61221 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ABCE1P61221 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ABCE1P61221 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ABCE1P61221 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
ABCE1P61221 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ABCE1P61221 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ABCE1P61221 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ABCE1P61221 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ABCE1P61221 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ABCE1P61221 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
ABCE1P61221 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ABCE1P61221 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ABCE1P61221 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ABCE1P61221 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ABCE1P61221 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
ABCE1P61221 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ABCE1P61221 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ABCE1P61221 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ABCE1P61221 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ABCE1P61221 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ABCE1P61221 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ABCE1P61221 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
ABCE1P61221 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ABCE1P61221 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ABCE1P61221 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ABCE1P61221 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ABCE1P61221 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ABCE1P61221 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ABCE1P61221 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ABCE1P61221 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ABCE1P61221 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ABCE1P61221 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ABCE1P61221 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ABCE1P61221 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ABCE1P61221 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ABCE1P61221 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ABCE1P61221 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ABCE1P61221 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ABCE1P61221 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ABCE1P61221 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ABCE1P61221 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ABCE1P61221 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ABCE1P61221 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ABCE1P61221 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ABCE1P61221 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ABCE1P61221 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ABCE1P61221 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ABCE1P61221 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ABCE1P61221 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ABCE1P61221 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ABCE1P61221 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
ABCE1P61221 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ABCE1P61221 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms