Protein–RNA interactions for Protein: P59044

NLRP6, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 892 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP6P59044 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NLRP6P59044 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NLRP6P59044 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NLRP6P59044 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NLRP6P59044 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NLRP6P59044 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NLRP6P59044 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NLRP6P59044 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NLRP6P59044 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NLRP6P59044 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NLRP6P59044 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NLRP6P59044 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NLRP6P59044 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NLRP6P59044 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NLRP6P59044 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NLRP6P59044 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NLRP6P59044 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NLRP6P59044 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NLRP6P59044 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NLRP6P59044 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NLRP6P59044 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NLRP6P59044 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NLRP6P59044 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
NLRP6P59044 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NLRP6P59044 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NLRP6P59044 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NLRP6P59044 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NLRP6P59044 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NLRP6P59044 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NLRP6P59044 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NLRP6P59044 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NLRP6P59044 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NLRP6P59044 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NLRP6P59044 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NLRP6P59044 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NLRP6P59044 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NLRP6P59044 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
NLRP6P59044 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
NLRP6P59044 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
NLRP6P59044 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NLRP6P59044 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NLRP6P59044 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NLRP6P59044 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NLRP6P59044 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NLRP6P59044 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NLRP6P59044 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NLRP6P59044 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NLRP6P59044 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
NLRP6P59044 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NLRP6P59044 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NLRP6P59044 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NLRP6P59044 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NLRP6P59044 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NLRP6P59044 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NLRP6P59044 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NLRP6P59044 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NLRP6P59044 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NLRP6P59044 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NLRP6P59044 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NLRP6P59044 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
NLRP6P59044 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NLRP6P59044 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NLRP6P59044 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NLRP6P59044 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NLRP6P59044 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NLRP6P59044 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NLRP6P59044 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NLRP6P59044 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NLRP6P59044 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NLRP6P59044 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NLRP6P59044 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NLRP6P59044 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NLRP6P59044 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NLRP6P59044 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NLRP6P59044 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NLRP6P59044 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NLRP6P59044 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NLRP6P59044 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NLRP6P59044 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NLRP6P59044 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NLRP6P59044 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NLRP6P59044 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NLRP6P59044 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NLRP6P59044 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NLRP6P59044 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NLRP6P59044 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NLRP6P59044 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
NLRP6P59044 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NLRP6P59044 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NLRP6P59044 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
NLRP6P59044 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
NLRP6P59044 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NLRP6P59044 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NLRP6P59044 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
NLRP6P59044 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
NLRP6P59044 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
NLRP6P59044 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
NLRP6P59044 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
NLRP6P59044 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NLRP6P59044 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms