Protein–RNA interactions for Protein: P56545

CTBP2, C-terminal-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTBP2P56545 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTBP2P56545 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTBP2P56545 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTBP2P56545 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTBP2P56545 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTBP2P56545 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTBP2P56545 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTBP2P56545 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTBP2P56545 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTBP2P56545 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTBP2P56545 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTBP2P56545 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTBP2P56545 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTBP2P56545 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTBP2P56545 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTBP2P56545 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTBP2P56545 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTBP2P56545 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTBP2P56545 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTBP2P56545 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTBP2P56545 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTBP2P56545 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTBP2P56545 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CTBP2P56545 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTBP2P56545 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTBP2P56545 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTBP2P56545 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTBP2P56545 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTBP2P56545 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTBP2P56545 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTBP2P56545 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTBP2P56545 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CTBP2P56545 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTBP2P56545 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTBP2P56545 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTBP2P56545 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTBP2P56545 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTBP2P56545 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTBP2P56545 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTBP2P56545 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTBP2P56545 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTBP2P56545 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CTBP2P56545 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTBP2P56545 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTBP2P56545 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTBP2P56545 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTBP2P56545 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTBP2P56545 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTBP2P56545 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTBP2P56545 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTBP2P56545 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTBP2P56545 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTBP2P56545 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTBP2P56545 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CTBP2P56545 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTBP2P56545 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTBP2P56545 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTBP2P56545 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTBP2P56545 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTBP2P56545 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTBP2P56545 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTBP2P56545 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTBP2P56545 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTBP2P56545 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTBP2P56545 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTBP2P56545 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTBP2P56545 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTBP2P56545 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTBP2P56545 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTBP2P56545 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTBP2P56545 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTBP2P56545 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTBP2P56545 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTBP2P56545 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTBP2P56545 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTBP2P56545 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTBP2P56545 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTBP2P56545 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTBP2P56545 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CTBP2P56545 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CTBP2P56545 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTBP2P56545 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTBP2P56545 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTBP2P56545 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTBP2P56545 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTBP2P56545 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTBP2P56545 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTBP2P56545 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTBP2P56545 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTBP2P56545 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTBP2P56545 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTBP2P56545 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTBP2P56545 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTBP2P56545 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTBP2P56545 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTBP2P56545 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTBP2P56545 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTBP2P56545 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTBP2P56545 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTBP2P56545 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.2 ms