Protein–RNA interactions for Protein: P48163

ME1, NADP-dependent malic enzyme, humanhuman

Predictions only

Length 572 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ME1P48163 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ME1P48163 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ME1P48163 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ME1P48163 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ME1P48163 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ME1P48163 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ME1P48163 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ME1P48163 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ME1P48163 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ME1P48163 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ME1P48163 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ME1P48163 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ME1P48163 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ME1P48163 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ME1P48163 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ME1P48163 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ME1P48163 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ME1P48163 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ME1P48163 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ME1P48163 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ME1P48163 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ME1P48163 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ME1P48163 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ME1P48163 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ME1P48163 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ME1P48163 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ME1P48163 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ME1P48163 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ME1P48163 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ME1P48163 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ME1P48163 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ME1P48163 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ME1P48163 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ME1P48163 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ME1P48163 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ME1P48163 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ME1P48163 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ME1P48163 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ME1P48163 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ME1P48163 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ME1P48163 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ME1P48163 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ME1P48163 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ME1P48163 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ME1P48163 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ME1P48163 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ME1P48163 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ME1P48163 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ME1P48163 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ME1P48163 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ME1P48163 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ME1P48163 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ME1P48163 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ME1P48163 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ME1P48163 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ME1P48163 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ME1P48163 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ME1P48163 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ME1P48163 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
ME1P48163 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ME1P48163 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ME1P48163 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ME1P48163 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ME1P48163 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ME1P48163 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ME1P48163 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ME1P48163 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ME1P48163 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ME1P48163 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ME1P48163 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ME1P48163 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ME1P48163 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
ME1P48163 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
ME1P48163 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ME1P48163 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ME1P48163 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ME1P48163 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ME1P48163 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ME1P48163 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ME1P48163 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ME1P48163 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ME1P48163 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ME1P48163 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ME1P48163 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ME1P48163 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ME1P48163 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ME1P48163 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ME1P48163 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ME1P48163 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ME1P48163 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ME1P48163 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ME1P48163 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ME1P48163 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ME1P48163 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ME1P48163 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ME1P48163 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ME1P48163 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ME1P48163 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ME1P48163 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ME1P48163 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.6 ms