Protein–RNA interactions for Protein: P29320

EPHA3, Ephrin type-A receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 983 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHA3P29320 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EPHA3P29320 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EPHA3P29320 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EPHA3P29320 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EPHA3P29320 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EPHA3P29320 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
EPHA3P29320 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EPHA3P29320 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EPHA3P29320 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EPHA3P29320 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EPHA3P29320 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EPHA3P29320 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
EPHA3P29320 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
EPHA3P29320 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
EPHA3P29320 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EPHA3P29320 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EPHA3P29320 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
EPHA3P29320 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
EPHA3P29320 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
EPHA3P29320 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EPHA3P29320 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
EPHA3P29320 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EPHA3P29320 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
EPHA3P29320 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EPHA3P29320 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EPHA3P29320 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
EPHA3P29320 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
EPHA3P29320 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EPHA3P29320 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EPHA3P29320 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EPHA3P29320 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
EPHA3P29320 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
EPHA3P29320 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EPHA3P29320 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EPHA3P29320 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EPHA3P29320 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
EPHA3P29320 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
EPHA3P29320 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
EPHA3P29320 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
EPHA3P29320 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
EPHA3P29320 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
EPHA3P29320 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
EPHA3P29320 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
EPHA3P29320 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
EPHA3P29320 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
EPHA3P29320 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
EPHA3P29320 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
EPHA3P29320 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
EPHA3P29320 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
EPHA3P29320 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
EPHA3P29320 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
EPHA3P29320 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
EPHA3P29320 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
EPHA3P29320 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
EPHA3P29320 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
EPHA3P29320 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
EPHA3P29320 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
EPHA3P29320 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
EPHA3P29320 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
EPHA3P29320 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
EPHA3P29320 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
EPHA3P29320 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
EPHA3P29320 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
EPHA3P29320 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
EPHA3P29320 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
EPHA3P29320 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
EPHA3P29320 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
EPHA3P29320 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
EPHA3P29320 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
EPHA3P29320 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
EPHA3P29320 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
EPHA3P29320 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
EPHA3P29320 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
EPHA3P29320 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
EPHA3P29320 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
EPHA3P29320 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
EPHA3P29320 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
EPHA3P29320 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
EPHA3P29320 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
EPHA3P29320 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
EPHA3P29320 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
EPHA3P29320 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
EPHA3P29320 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
EPHA3P29320 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
EPHA3P29320 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
EPHA3P29320 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
EPHA3P29320 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
EPHA3P29320 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
EPHA3P29320 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
EPHA3P29320 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
EPHA3P29320 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
EPHA3P29320 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
EPHA3P29320 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
EPHA3P29320 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
EPHA3P29320 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
EPHA3P29320 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
EPHA3P29320 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
EPHA3P29320 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
EPHA3P29320 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
EPHA3P29320 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms