Protein–RNA interactions for Protein: P26006

ITGA3, Integrin alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,051 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA3P26006 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ITGA3P26006 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ITGA3P26006 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ITGA3P26006 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ITGA3P26006 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ITGA3P26006 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ITGA3P26006 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
ITGA3P26006 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
ITGA3P26006 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ITGA3P26006 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ITGA3P26006 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ITGA3P26006 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ITGA3P26006 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ITGA3P26006 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ITGA3P26006 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
ITGA3P26006 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ITGA3P26006 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ITGA3P26006 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ITGA3P26006 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ITGA3P26006 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ITGA3P26006 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
ITGA3P26006 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ITGA3P26006 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ITGA3P26006 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ITGA3P26006 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ITGA3P26006 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ITGA3P26006 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ITGA3P26006 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
ITGA3P26006 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ITGA3P26006 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ITGA3P26006 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ITGA3P26006 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ITGA3P26006 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ITGA3P26006 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ITGA3P26006 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ITGA3P26006 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ITGA3P26006 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ITGA3P26006 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ITGA3P26006 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ITGA3P26006 DENND5B-202ENST00000389082 9470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ITGA3P26006 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ITGA3P26006 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ITGA3P26006 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ITGA3P26006 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ITGA3P26006 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ITGA3P26006 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ITGA3P26006 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ITGA3P26006 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ITGA3P26006 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ITGA3P26006 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ITGA3P26006 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ITGA3P26006 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ITGA3P26006 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ITGA3P26006 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ITGA3P26006 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ITGA3P26006 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ITGA3P26006 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ITGA3P26006 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ITGA3P26006 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ITGA3P26006 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
ITGA3P26006 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ITGA3P26006 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
ITGA3P26006 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ITGA3P26006 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
ITGA3P26006 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ITGA3P26006 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ITGA3P26006 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ITGA3P26006 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ITGA3P26006 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ITGA3P26006 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ITGA3P26006 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ITGA3P26006 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ITGA3P26006 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ITGA3P26006 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
ITGA3P26006 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ITGA3P26006 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ITGA3P26006 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ITGA3P26006 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ITGA3P26006 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ITGA3P26006 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ITGA3P26006 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ITGA3P26006 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ITGA3P26006 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ITGA3P26006 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ITGA3P26006 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ITGA3P26006 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ITGA3P26006 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ITGA3P26006 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
ITGA3P26006 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ITGA3P26006 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ITGA3P26006 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ITGA3P26006 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ITGA3P26006 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ITGA3P26006 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ITGA3P26006 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ITGA3P26006 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ITGA3P26006 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ITGA3P26006 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
ITGA3P26006 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ITGA3P26006 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms