Protein–RNA interactions for Protein: O95833

CLIC3, Chloride intracellular channel protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIC3O95833 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLIC3O95833 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLIC3O95833 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLIC3O95833 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLIC3O95833 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLIC3O95833 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLIC3O95833 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLIC3O95833 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLIC3O95833 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLIC3O95833 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLIC3O95833 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLIC3O95833 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLIC3O95833 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLIC3O95833 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLIC3O95833 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLIC3O95833 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLIC3O95833 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CLIC3O95833 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CLIC3O95833 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLIC3O95833 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CLIC3O95833 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLIC3O95833 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLIC3O95833 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLIC3O95833 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLIC3O95833 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLIC3O95833 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLIC3O95833 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CLIC3O95833 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLIC3O95833 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLIC3O95833 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLIC3O95833 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLIC3O95833 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLIC3O95833 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLIC3O95833 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLIC3O95833 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLIC3O95833 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLIC3O95833 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLIC3O95833 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLIC3O95833 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLIC3O95833 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLIC3O95833 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLIC3O95833 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLIC3O95833 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLIC3O95833 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CLIC3O95833 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLIC3O95833 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLIC3O95833 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLIC3O95833 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLIC3O95833 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLIC3O95833 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLIC3O95833 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLIC3O95833 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLIC3O95833 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLIC3O95833 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLIC3O95833 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLIC3O95833 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLIC3O95833 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLIC3O95833 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLIC3O95833 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLIC3O95833 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLIC3O95833 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLIC3O95833 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLIC3O95833 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLIC3O95833 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLIC3O95833 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLIC3O95833 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLIC3O95833 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLIC3O95833 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLIC3O95833 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLIC3O95833 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLIC3O95833 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLIC3O95833 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLIC3O95833 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CLIC3O95833 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLIC3O95833 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLIC3O95833 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLIC3O95833 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLIC3O95833 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLIC3O95833 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CLIC3O95833 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLIC3O95833 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLIC3O95833 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLIC3O95833 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLIC3O95833 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLIC3O95833 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLIC3O95833 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLIC3O95833 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLIC3O95833 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLIC3O95833 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLIC3O95833 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLIC3O95833 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLIC3O95833 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLIC3O95833 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLIC3O95833 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLIC3O95833 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLIC3O95833 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLIC3O95833 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CLIC3O95833 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CLIC3O95833 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CLIC3O95833 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.7 ms