Protein–RNA interactions for Protein: V9GYD0

ARL2-SNX15, ARL2-SNX15 readthrough (NMD candidate), humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARL2-SNX15V9GYD0 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ARL2-SNX15V9GYD0 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ARL2-SNX15V9GYD0 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ARL2-SNX15V9GYD0 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ARL2-SNX15V9GYD0 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ARL2-SNX15V9GYD0 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ARL2-SNX15V9GYD0 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ARL2-SNX15V9GYD0 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ARL2-SNX15V9GYD0 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ARL2-SNX15V9GYD0 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ARL2-SNX15V9GYD0 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
ARL2-SNX15V9GYD0 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ARL2-SNX15V9GYD0 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ARL2-SNX15V9GYD0 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ARL2-SNX15V9GYD0 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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ARL2-SNX15V9GYD0 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
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ARL2-SNX15V9GYD0 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
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ARL2-SNX15V9GYD0 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
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ARL2-SNX15V9GYD0 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ARL2-SNX15V9GYD0 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ARL2-SNX15V9GYD0 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ARL2-SNX15V9GYD0 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ARL2-SNX15V9GYD0 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
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ARL2-SNX15V9GYD0 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ARL2-SNX15V9GYD0 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ARL2-SNX15V9GYD0 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ARL2-SNX15V9GYD0 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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ARL2-SNX15V9GYD0 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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ARL2-SNX15V9GYD0 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ARL2-SNX15V9GYD0 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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ARL2-SNX15V9GYD0 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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ARL2-SNX15V9GYD0 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
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ARL2-SNX15V9GYD0 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ARL2-SNX15V9GYD0 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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ARL2-SNX15V9GYD0 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ARL2-SNX15V9GYD0 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ARL2-SNX15V9GYD0 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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ARL2-SNX15V9GYD0 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ARL2-SNX15V9GYD0 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ARL2-SNX15V9GYD0 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ARL2-SNX15V9GYD0 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ARL2-SNX15V9GYD0 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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ARL2-SNX15V9GYD0 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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ARL2-SNX15V9GYD0 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
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ARL2-SNX15V9GYD0 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ARL2-SNX15V9GYD0 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
ARL2-SNX15V9GYD0 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ARL2-SNX15V9GYD0 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ARL2-SNX15V9GYD0 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ARL2-SNX15V9GYD0 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ARL2-SNX15V9GYD0 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ARL2-SNX15V9GYD0 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ARL2-SNX15V9GYD0 AFF3-202ENST00000409236 9849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ARL2-SNX15V9GYD0 CEP164-201ENST00000278935 5630 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ARL2-SNX15V9GYD0 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ARL2-SNX15V9GYD0 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ARL2-SNX15V9GYD0 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ARL2-SNX15V9GYD0 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ARL2-SNX15V9GYD0 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ARL2-SNX15V9GYD0 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ARL2-SNX15V9GYD0 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ARL2-SNX15V9GYD0 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ARL2-SNX15V9GYD0 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ARL2-SNX15V9GYD0 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ARL2-SNX15V9GYD0 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ARL2-SNX15V9GYD0 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
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