Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXT8

RNF17, RING finger protein 17, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF17Q9BXT8 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RNF17Q9BXT8 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RNF17Q9BXT8 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RNF17Q9BXT8 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RNF17Q9BXT8 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
RNF17Q9BXT8 NOP2-211ENST00000540228 668 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RNF17Q9BXT8 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
RNF17Q9BXT8 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
RNF17Q9BXT8 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
RNF17Q9BXT8 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
RNF17Q9BXT8 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RNF17Q9BXT8 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RNF17Q9BXT8 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RNF17Q9BXT8 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RNF17Q9BXT8 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RNF17Q9BXT8 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RNF17Q9BXT8 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RNF17Q9BXT8 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RNF17Q9BXT8 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RNF17Q9BXT8 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RNF17Q9BXT8 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RNF17Q9BXT8 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RNF17Q9BXT8 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
RNF17Q9BXT8 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
RNF17Q9BXT8 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
RNF17Q9BXT8 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
RNF17Q9BXT8 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
RNF17Q9BXT8 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
RNF17Q9BXT8 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
RNF17Q9BXT8 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
RNF17Q9BXT8 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
RNF17Q9BXT8 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
RNF17Q9BXT8 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
RNF17Q9BXT8 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
RNF17Q9BXT8 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
RNF17Q9BXT8 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.46
RNF17Q9BXT8 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
RNF17Q9BXT8 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
RNF17Q9BXT8 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
RNF17Q9BXT8 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
RNF17Q9BXT8 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
RNF17Q9BXT8 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RNF17Q9BXT8 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RNF17Q9BXT8 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RNF17Q9BXT8 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RNF17Q9BXT8 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RNF17Q9BXT8 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RNF17Q9BXT8 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RNF17Q9BXT8 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RNF17Q9BXT8 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RNF17Q9BXT8 FAM221A-203ENST00000409653 761 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RNF17Q9BXT8 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RNF17Q9BXT8 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RNF17Q9BXT8 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RNF17Q9BXT8 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RNF17Q9BXT8 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RNF17Q9BXT8 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RNF17Q9BXT8 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RNF17Q9BXT8 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
RNF17Q9BXT8 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
RNF17Q9BXT8 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
RNF17Q9BXT8 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RNF17Q9BXT8 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
RNF17Q9BXT8 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
RNF17Q9BXT8 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RNF17Q9BXT8 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RNF17Q9BXT8 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RNF17Q9BXT8 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RNF17Q9BXT8 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RNF17Q9BXT8 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RNF17Q9BXT8 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RNF17Q9BXT8 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
RNF17Q9BXT8 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RNF17Q9BXT8 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RNF17Q9BXT8 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RNF17Q9BXT8 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RNF17Q9BXT8 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RNF17Q9BXT8 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RNF17Q9BXT8 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
RNF17Q9BXT8 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RNF17Q9BXT8 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RNF17Q9BXT8 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RNF17Q9BXT8 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RNF17Q9BXT8 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RNF17Q9BXT8 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RNF17Q9BXT8 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RNF17Q9BXT8 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RNF17Q9BXT8 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RNF17Q9BXT8 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RNF17Q9BXT8 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RNF17Q9BXT8 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RNF17Q9BXT8 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RNF17Q9BXT8 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RNF17Q9BXT8 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RNF17Q9BXT8 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RNF17Q9BXT8 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RNF17Q9BXT8 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RNF17Q9BXT8 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RNF17Q9BXT8 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RNF17Q9BXT8 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms