Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ16

SPOCK3, Testican-3, humanhuman

Predictions only

Length 436 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPOCK3Q9BQ16 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SPOCK3Q9BQ16 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SPOCK3Q9BQ16 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SPOCK3Q9BQ16 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SPOCK3Q9BQ16 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SPOCK3Q9BQ16 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SPOCK3Q9BQ16 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SPOCK3Q9BQ16 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SPOCK3Q9BQ16 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SPOCK3Q9BQ16 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SPOCK3Q9BQ16 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SPOCK3Q9BQ16 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SPOCK3Q9BQ16 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SPOCK3Q9BQ16 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SPOCK3Q9BQ16 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SPOCK3Q9BQ16 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SPOCK3Q9BQ16 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SPOCK3Q9BQ16 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SPOCK3Q9BQ16 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SPOCK3Q9BQ16 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SPOCK3Q9BQ16 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SPOCK3Q9BQ16 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SPOCK3Q9BQ16 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SPOCK3Q9BQ16 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SPOCK3Q9BQ16 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
SPOCK3Q9BQ16 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SPOCK3Q9BQ16 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SPOCK3Q9BQ16 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
SPOCK3Q9BQ16 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SPOCK3Q9BQ16 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SPOCK3Q9BQ16 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SPOCK3Q9BQ16 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SPOCK3Q9BQ16 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SPOCK3Q9BQ16 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SPOCK3Q9BQ16 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SPOCK3Q9BQ16 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
SPOCK3Q9BQ16 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SPOCK3Q9BQ16 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SPOCK3Q9BQ16 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
SPOCK3Q9BQ16 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SPOCK3Q9BQ16 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SPOCK3Q9BQ16 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SPOCK3Q9BQ16 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SPOCK3Q9BQ16 PRDM16-203ENST00000378391 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SPOCK3Q9BQ16 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SPOCK3Q9BQ16 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SPOCK3Q9BQ16 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SPOCK3Q9BQ16 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SPOCK3Q9BQ16 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SPOCK3Q9BQ16 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SPOCK3Q9BQ16 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SPOCK3Q9BQ16 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SPOCK3Q9BQ16 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SPOCK3Q9BQ16 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SPOCK3Q9BQ16 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SPOCK3Q9BQ16 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SPOCK3Q9BQ16 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SPOCK3Q9BQ16 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
SPOCK3Q9BQ16 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SPOCK3Q9BQ16 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SPOCK3Q9BQ16 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SPOCK3Q9BQ16 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SPOCK3Q9BQ16 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SPOCK3Q9BQ16 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SPOCK3Q9BQ16 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SPOCK3Q9BQ16 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SPOCK3Q9BQ16 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SPOCK3Q9BQ16 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SPOCK3Q9BQ16 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SPOCK3Q9BQ16 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SPOCK3Q9BQ16 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SPOCK3Q9BQ16 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SPOCK3Q9BQ16 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SPOCK3Q9BQ16 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SPOCK3Q9BQ16 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SPOCK3Q9BQ16 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SPOCK3Q9BQ16 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
SPOCK3Q9BQ16 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SPOCK3Q9BQ16 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SPOCK3Q9BQ16 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SPOCK3Q9BQ16 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SPOCK3Q9BQ16 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SPOCK3Q9BQ16 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SPOCK3Q9BQ16 ATP6V0B-201ENST00000236067 944 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SPOCK3Q9BQ16 CTHRC1-201ENST00000330295 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SPOCK3Q9BQ16 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SPOCK3Q9BQ16 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SPOCK3Q9BQ16 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SPOCK3Q9BQ16 H2AFV-207ENST00000446531 1041 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SPOCK3Q9BQ16 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SPOCK3Q9BQ16 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SPOCK3Q9BQ16 ATP6V0B-211ENST00000498664 825 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SPOCK3Q9BQ16 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SPOCK3Q9BQ16 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SPOCK3Q9BQ16 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SPOCK3Q9BQ16 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SPOCK3Q9BQ16 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
SPOCK3Q9BQ16 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SPOCK3Q9BQ16 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
SPOCK3Q9BQ16 MIR6799-201ENST00000620297 69 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.1 ms