Protein–RNA interactions for Protein: Q96FJ0

STAMBPL1, AMSH-like protease, humanhuman

Predictions only

Length 436 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STAMBPL1Q96FJ0 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
STAMBPL1Q96FJ0 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
STAMBPL1Q96FJ0 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
STAMBPL1Q96FJ0 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
STAMBPL1Q96FJ0 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
STAMBPL1Q96FJ0 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
STAMBPL1Q96FJ0 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
STAMBPL1Q96FJ0 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
STAMBPL1Q96FJ0 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
STAMBPL1Q96FJ0 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
STAMBPL1Q96FJ0 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
STAMBPL1Q96FJ0 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
STAMBPL1Q96FJ0 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
STAMBPL1Q96FJ0 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
STAMBPL1Q96FJ0 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
STAMBPL1Q96FJ0 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
STAMBPL1Q96FJ0 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
STAMBPL1Q96FJ0 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
STAMBPL1Q96FJ0 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
STAMBPL1Q96FJ0 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
STAMBPL1Q96FJ0 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
STAMBPL1Q96FJ0 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
STAMBPL1Q96FJ0 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
STAMBPL1Q96FJ0 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
STAMBPL1Q96FJ0 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
STAMBPL1Q96FJ0 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
STAMBPL1Q96FJ0 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
STAMBPL1Q96FJ0 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
STAMBPL1Q96FJ0 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
STAMBPL1Q96FJ0 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
STAMBPL1Q96FJ0 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
STAMBPL1Q96FJ0 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
STAMBPL1Q96FJ0 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
STAMBPL1Q96FJ0 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
STAMBPL1Q96FJ0 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
STAMBPL1Q96FJ0 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
STAMBPL1Q96FJ0 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
STAMBPL1Q96FJ0 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
STAMBPL1Q96FJ0 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
STAMBPL1Q96FJ0 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
STAMBPL1Q96FJ0 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
STAMBPL1Q96FJ0 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
STAMBPL1Q96FJ0 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
STAMBPL1Q96FJ0 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
STAMBPL1Q96FJ0 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
STAMBPL1Q96FJ0 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
STAMBPL1Q96FJ0 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
STAMBPL1Q96FJ0 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
STAMBPL1Q96FJ0 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
STAMBPL1Q96FJ0 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
STAMBPL1Q96FJ0 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
STAMBPL1Q96FJ0 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
STAMBPL1Q96FJ0 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
STAMBPL1Q96FJ0 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
STAMBPL1Q96FJ0 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
STAMBPL1Q96FJ0 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
STAMBPL1Q96FJ0 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
STAMBPL1Q96FJ0 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
STAMBPL1Q96FJ0 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
STAMBPL1Q96FJ0 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
STAMBPL1Q96FJ0 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
STAMBPL1Q96FJ0 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
STAMBPL1Q96FJ0 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
STAMBPL1Q96FJ0 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
STAMBPL1Q96FJ0 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
STAMBPL1Q96FJ0 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
STAMBPL1Q96FJ0 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
STAMBPL1Q96FJ0 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
STAMBPL1Q96FJ0 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
STAMBPL1Q96FJ0 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
STAMBPL1Q96FJ0 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
STAMBPL1Q96FJ0 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
STAMBPL1Q96FJ0 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
STAMBPL1Q96FJ0 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
STAMBPL1Q96FJ0 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
STAMBPL1Q96FJ0 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
STAMBPL1Q96FJ0 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
STAMBPL1Q96FJ0 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
STAMBPL1Q96FJ0 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
STAMBPL1Q96FJ0 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
STAMBPL1Q96FJ0 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
STAMBPL1Q96FJ0 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
STAMBPL1Q96FJ0 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.37
STAMBPL1Q96FJ0 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
STAMBPL1Q96FJ0 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
STAMBPL1Q96FJ0 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
STAMBPL1Q96FJ0 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
STAMBPL1Q96FJ0 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
STAMBPL1Q96FJ0 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
STAMBPL1Q96FJ0 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
STAMBPL1Q96FJ0 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
STAMBPL1Q96FJ0 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
STAMBPL1Q96FJ0 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
STAMBPL1Q96FJ0 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
STAMBPL1Q96FJ0 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
STAMBPL1Q96FJ0 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
STAMBPL1Q96FJ0 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
STAMBPL1Q96FJ0 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
STAMBPL1Q96FJ0 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
STAMBPL1Q96FJ0 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms