Protein–RNA interactions for Protein: Q8NE22

SETD9, SET domain-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SETD9Q8NE22 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SETD9Q8NE22 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SETD9Q8NE22 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SETD9Q8NE22 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SETD9Q8NE22 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SETD9Q8NE22 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SETD9Q8NE22 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SETD9Q8NE22 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SETD9Q8NE22 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SETD9Q8NE22 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SETD9Q8NE22 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SETD9Q8NE22 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SETD9Q8NE22 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SETD9Q8NE22 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SETD9Q8NE22 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SETD9Q8NE22 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SETD9Q8NE22 C4A-259ENST00000498271 5269 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SETD9Q8NE22 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SETD9Q8NE22 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SETD9Q8NE22 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SETD9Q8NE22 UNC13B-203ENST00000396787 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SETD9Q8NE22 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SETD9Q8NE22 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SETD9Q8NE22 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SETD9Q8NE22 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SETD9Q8NE22 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SETD9Q8NE22 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SETD9Q8NE22 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SETD9Q8NE22 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SETD9Q8NE22 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SETD9Q8NE22 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SETD9Q8NE22 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SETD9Q8NE22 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SETD9Q8NE22 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SETD9Q8NE22 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SETD9Q8NE22 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SETD9Q8NE22 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SETD9Q8NE22 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SETD9Q8NE22 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SETD9Q8NE22 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SETD9Q8NE22 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SETD9Q8NE22 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SETD9Q8NE22 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SETD9Q8NE22 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SETD9Q8NE22 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SETD9Q8NE22 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SETD9Q8NE22 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SETD9Q8NE22 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SETD9Q8NE22 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SETD9Q8NE22 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SETD9Q8NE22 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SETD9Q8NE22 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SETD9Q8NE22 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SETD9Q8NE22 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SETD9Q8NE22 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SETD9Q8NE22 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SETD9Q8NE22 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SETD9Q8NE22 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SETD9Q8NE22 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SETD9Q8NE22 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SETD9Q8NE22 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SETD9Q8NE22 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SETD9Q8NE22 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SETD9Q8NE22 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SETD9Q8NE22 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SETD9Q8NE22 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SETD9Q8NE22 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SETD9Q8NE22 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SETD9Q8NE22 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SETD9Q8NE22 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SETD9Q8NE22 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SETD9Q8NE22 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SETD9Q8NE22 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SETD9Q8NE22 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SETD9Q8NE22 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SETD9Q8NE22 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SETD9Q8NE22 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SETD9Q8NE22 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SETD9Q8NE22 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SETD9Q8NE22 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SETD9Q8NE22 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SETD9Q8NE22 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SETD9Q8NE22 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SETD9Q8NE22 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SETD9Q8NE22 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SETD9Q8NE22 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SETD9Q8NE22 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SETD9Q8NE22 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SETD9Q8NE22 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SETD9Q8NE22 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SETD9Q8NE22 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SETD9Q8NE22 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SETD9Q8NE22 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SETD9Q8NE22 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SETD9Q8NE22 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SETD9Q8NE22 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SETD9Q8NE22 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SETD9Q8NE22 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SETD9Q8NE22 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SETD9Q8NE22 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.5 ms