Protein–RNA interactions for Protein: Q8NDW4

ZNF248, Zinc finger protein 248, humanhuman

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Length 579 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF248Q8NDW4 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF248Q8NDW4 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF248Q8NDW4 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF248Q8NDW4 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF248Q8NDW4 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF248Q8NDW4 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF248Q8NDW4 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF248Q8NDW4 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF248Q8NDW4 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF248Q8NDW4 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF248Q8NDW4 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF248Q8NDW4 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF248Q8NDW4 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF248Q8NDW4 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF248Q8NDW4 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF248Q8NDW4 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF248Q8NDW4 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF248Q8NDW4 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF248Q8NDW4 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF248Q8NDW4 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF248Q8NDW4 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF248Q8NDW4 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF248Q8NDW4 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF248Q8NDW4 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF248Q8NDW4 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF248Q8NDW4 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF248Q8NDW4 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF248Q8NDW4 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF248Q8NDW4 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF248Q8NDW4 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF248Q8NDW4 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF248Q8NDW4 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF248Q8NDW4 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF248Q8NDW4 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF248Q8NDW4 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF248Q8NDW4 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF248Q8NDW4 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF248Q8NDW4 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF248Q8NDW4 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF248Q8NDW4 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF248Q8NDW4 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF248Q8NDW4 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF248Q8NDW4 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF248Q8NDW4 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF248Q8NDW4 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF248Q8NDW4 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF248Q8NDW4 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF248Q8NDW4 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF248Q8NDW4 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF248Q8NDW4 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF248Q8NDW4 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF248Q8NDW4 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF248Q8NDW4 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF248Q8NDW4 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF248Q8NDW4 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF248Q8NDW4 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF248Q8NDW4 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF248Q8NDW4 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF248Q8NDW4 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF248Q8NDW4 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF248Q8NDW4 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF248Q8NDW4 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF248Q8NDW4 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF248Q8NDW4 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF248Q8NDW4 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF248Q8NDW4 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF248Q8NDW4 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF248Q8NDW4 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF248Q8NDW4 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF248Q8NDW4 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF248Q8NDW4 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF248Q8NDW4 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
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ZNF248Q8NDW4 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF248Q8NDW4 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF248Q8NDW4 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF248Q8NDW4 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF248Q8NDW4 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF248Q8NDW4 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF248Q8NDW4 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF248Q8NDW4 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF248Q8NDW4 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF248Q8NDW4 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF248Q8NDW4 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF248Q8NDW4 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF248Q8NDW4 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF248Q8NDW4 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF248Q8NDW4 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF248Q8NDW4 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF248Q8NDW4 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF248Q8NDW4 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF248Q8NDW4 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF248Q8NDW4 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF248Q8NDW4 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF248Q8NDW4 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF248Q8NDW4 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF248Q8NDW4 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF248Q8NDW4 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
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