Protein–RNA interactions for Protein: Q8N448

LNX2, Ligand of Numb protein X 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LNX2Q8N448 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LNX2Q8N448 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LNX2Q8N448 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LNX2Q8N448 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LNX2Q8N448 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LNX2Q8N448 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LNX2Q8N448 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LNX2Q8N448 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LNX2Q8N448 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LNX2Q8N448 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LNX2Q8N448 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LNX2Q8N448 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LNX2Q8N448 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LNX2Q8N448 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LNX2Q8N448 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LNX2Q8N448 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LNX2Q8N448 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LNX2Q8N448 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LNX2Q8N448 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LNX2Q8N448 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LNX2Q8N448 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LNX2Q8N448 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LNX2Q8N448 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
LNX2Q8N448 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LNX2Q8N448 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LNX2Q8N448 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LNX2Q8N448 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LNX2Q8N448 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LNX2Q8N448 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LNX2Q8N448 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LNX2Q8N448 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LNX2Q8N448 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LNX2Q8N448 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LNX2Q8N448 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LNX2Q8N448 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LNX2Q8N448 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LNX2Q8N448 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
LNX2Q8N448 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LNX2Q8N448 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LNX2Q8N448 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LNX2Q8N448 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LNX2Q8N448 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LNX2Q8N448 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
LNX2Q8N448 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LNX2Q8N448 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LNX2Q8N448 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LNX2Q8N448 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LNX2Q8N448 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LNX2Q8N448 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LNX2Q8N448 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
LNX2Q8N448 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LNX2Q8N448 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LNX2Q8N448 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LNX2Q8N448 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LNX2Q8N448 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LNX2Q8N448 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LNX2Q8N448 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LNX2Q8N448 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LNX2Q8N448 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LNX2Q8N448 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LNX2Q8N448 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LNX2Q8N448 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LNX2Q8N448 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LNX2Q8N448 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LNX2Q8N448 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LNX2Q8N448 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
LNX2Q8N448 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LNX2Q8N448 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
LNX2Q8N448 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LNX2Q8N448 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LNX2Q8N448 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LNX2Q8N448 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LNX2Q8N448 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LNX2Q8N448 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LNX2Q8N448 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LNX2Q8N448 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LNX2Q8N448 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LNX2Q8N448 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LNX2Q8N448 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LNX2Q8N448 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LNX2Q8N448 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LNX2Q8N448 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LNX2Q8N448 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LNX2Q8N448 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LNX2Q8N448 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LNX2Q8N448 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LNX2Q8N448 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LNX2Q8N448 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LNX2Q8N448 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LNX2Q8N448 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LNX2Q8N448 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LNX2Q8N448 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LNX2Q8N448 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
LNX2Q8N448 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LNX2Q8N448 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LNX2Q8N448 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LNX2Q8N448 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LNX2Q8N448 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LNX2Q8N448 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LNX2Q8N448 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
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