Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1Q0

LETMD1, LETM1 domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LETMD1Q6P1Q0 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LETMD1Q6P1Q0 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LETMD1Q6P1Q0 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LETMD1Q6P1Q0 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LETMD1Q6P1Q0 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LETMD1Q6P1Q0 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LETMD1Q6P1Q0 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LETMD1Q6P1Q0 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
LETMD1Q6P1Q0 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LETMD1Q6P1Q0 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LETMD1Q6P1Q0 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LETMD1Q6P1Q0 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LETMD1Q6P1Q0 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LETMD1Q6P1Q0 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
LETMD1Q6P1Q0 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
LETMD1Q6P1Q0 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
LETMD1Q6P1Q0 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LETMD1Q6P1Q0 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LETMD1Q6P1Q0 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LETMD1Q6P1Q0 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LETMD1Q6P1Q0 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LETMD1Q6P1Q0 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LETMD1Q6P1Q0 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LETMD1Q6P1Q0 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LETMD1Q6P1Q0 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LETMD1Q6P1Q0 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LETMD1Q6P1Q0 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LETMD1Q6P1Q0 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LETMD1Q6P1Q0 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LETMD1Q6P1Q0 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LETMD1Q6P1Q0 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LETMD1Q6P1Q0 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LETMD1Q6P1Q0 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LETMD1Q6P1Q0 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LETMD1Q6P1Q0 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LETMD1Q6P1Q0 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LETMD1Q6P1Q0 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LETMD1Q6P1Q0 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LETMD1Q6P1Q0 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LETMD1Q6P1Q0 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LETMD1Q6P1Q0 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LETMD1Q6P1Q0 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LETMD1Q6P1Q0 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
LETMD1Q6P1Q0 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LETMD1Q6P1Q0 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LETMD1Q6P1Q0 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LETMD1Q6P1Q0 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LETMD1Q6P1Q0 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LETMD1Q6P1Q0 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LETMD1Q6P1Q0 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LETMD1Q6P1Q0 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LETMD1Q6P1Q0 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LETMD1Q6P1Q0 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LETMD1Q6P1Q0 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LETMD1Q6P1Q0 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LETMD1Q6P1Q0 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
LETMD1Q6P1Q0 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LETMD1Q6P1Q0 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
LETMD1Q6P1Q0 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LETMD1Q6P1Q0 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LETMD1Q6P1Q0 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LETMD1Q6P1Q0 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LETMD1Q6P1Q0 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LETMD1Q6P1Q0 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LETMD1Q6P1Q0 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LETMD1Q6P1Q0 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LETMD1Q6P1Q0 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
LETMD1Q6P1Q0 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LETMD1Q6P1Q0 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LETMD1Q6P1Q0 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LETMD1Q6P1Q0 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LETMD1Q6P1Q0 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LETMD1Q6P1Q0 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LETMD1Q6P1Q0 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LETMD1Q6P1Q0 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LETMD1Q6P1Q0 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LETMD1Q6P1Q0 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LETMD1Q6P1Q0 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
LETMD1Q6P1Q0 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LETMD1Q6P1Q0 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LETMD1Q6P1Q0 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LETMD1Q6P1Q0 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LETMD1Q6P1Q0 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LETMD1Q6P1Q0 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LETMD1Q6P1Q0 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LETMD1Q6P1Q0 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LETMD1Q6P1Q0 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
LETMD1Q6P1Q0 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LETMD1Q6P1Q0 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LETMD1Q6P1Q0 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LETMD1Q6P1Q0 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LETMD1Q6P1Q0 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LETMD1Q6P1Q0 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LETMD1Q6P1Q0 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LETMD1Q6P1Q0 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LETMD1Q6P1Q0 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
LETMD1Q6P1Q0 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
LETMD1Q6P1Q0 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LETMD1Q6P1Q0 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
LETMD1Q6P1Q0 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms