Protein–RNA interactions for Protein: Q3YBM2

TMEM176B, Transmembrane protein 176B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 270 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM176BQ3YBM2 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEM176BQ3YBM2 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEM176BQ3YBM2 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEM176BQ3YBM2 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEM176BQ3YBM2 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEM176BQ3YBM2 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEM176BQ3YBM2 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEM176BQ3YBM2 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEM176BQ3YBM2 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEM176BQ3YBM2 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEM176BQ3YBM2 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEM176BQ3YBM2 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEM176BQ3YBM2 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEM176BQ3YBM2 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEM176BQ3YBM2 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEM176BQ3YBM2 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEM176BQ3YBM2 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEM176BQ3YBM2 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEM176BQ3YBM2 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEM176BQ3YBM2 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEM176BQ3YBM2 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEM176BQ3YBM2 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEM176BQ3YBM2 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEM176BQ3YBM2 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM176BQ3YBM2 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM176BQ3YBM2 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM176BQ3YBM2 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM176BQ3YBM2 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM176BQ3YBM2 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
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TMEM176BQ3YBM2 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM176BQ3YBM2 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM176BQ3YBM2 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM176BQ3YBM2 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM176BQ3YBM2 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM176BQ3YBM2 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM176BQ3YBM2 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM176BQ3YBM2 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM176BQ3YBM2 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM176BQ3YBM2 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM176BQ3YBM2 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM176BQ3YBM2 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM176BQ3YBM2 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM176BQ3YBM2 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM176BQ3YBM2 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM176BQ3YBM2 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM176BQ3YBM2 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM176BQ3YBM2 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM176BQ3YBM2 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM176BQ3YBM2 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM176BQ3YBM2 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM176BQ3YBM2 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM176BQ3YBM2 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM176BQ3YBM2 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
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TMEM176BQ3YBM2 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM176BQ3YBM2 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM176BQ3YBM2 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM176BQ3YBM2 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM176BQ3YBM2 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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TMEM176BQ3YBM2 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM176BQ3YBM2 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
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TMEM176BQ3YBM2 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM176BQ3YBM2 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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TMEM176BQ3YBM2 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM176BQ3YBM2 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM176BQ3YBM2 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM176BQ3YBM2 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM176BQ3YBM2 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM176BQ3YBM2 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM176BQ3YBM2 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM176BQ3YBM2 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM176BQ3YBM2 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM176BQ3YBM2 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM176BQ3YBM2 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM176BQ3YBM2 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM176BQ3YBM2 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM176BQ3YBM2 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM176BQ3YBM2 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM176BQ3YBM2 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM176BQ3YBM2 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM176BQ3YBM2 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM176BQ3YBM2 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM176BQ3YBM2 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM176BQ3YBM2 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM176BQ3YBM2 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM176BQ3YBM2 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM176BQ3YBM2 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM176BQ3YBM2 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM176BQ3YBM2 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM176BQ3YBM2 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM176BQ3YBM2 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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