Protein–RNA interactions for Protein: Q29983

MICA, MHC class I polypeptide-related sequence A, humanhuman

Predictions only

Length 383 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MICAQ29983 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MICAQ29983 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MICAQ29983 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
MICAQ29983 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MICAQ29983 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
MICAQ29983 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
MICAQ29983 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
MICAQ29983 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
MICAQ29983 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC15.46■□□□□ 0.06
MICAQ29983 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
MICAQ29983 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
MICAQ29983 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MICAQ29983 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MICAQ29983 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MICAQ29983 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MICAQ29983 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MICAQ29983 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MICAQ29983 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MICAQ29983 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MICAQ29983 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MICAQ29983 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MICAQ29983 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MICAQ29983 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MICAQ29983 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MICAQ29983 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MICAQ29983 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MICAQ29983 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MICAQ29983 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MICAQ29983 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MICAQ29983 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MICAQ29983 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
MICAQ29983 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MICAQ29983 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MICAQ29983 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MICAQ29983 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
MICAQ29983 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MICAQ29983 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
MICAQ29983 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
MICAQ29983 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MICAQ29983 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MICAQ29983 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MICAQ29983 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MICAQ29983 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MICAQ29983 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MICAQ29983 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MICAQ29983 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MICAQ29983 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MICAQ29983 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MICAQ29983 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MICAQ29983 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MICAQ29983 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MICAQ29983 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MICAQ29983 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MICAQ29983 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MICAQ29983 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MICAQ29983 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MICAQ29983 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MICAQ29983 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MICAQ29983 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MICAQ29983 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MICAQ29983 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MICAQ29983 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MICAQ29983 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MICAQ29983 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MICAQ29983 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MICAQ29983 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MICAQ29983 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MICAQ29983 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MICAQ29983 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MICAQ29983 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MICAQ29983 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MICAQ29983 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
MICAQ29983 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MICAQ29983 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MICAQ29983 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MICAQ29983 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MICAQ29983 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MICAQ29983 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MICAQ29983 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MICAQ29983 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
MICAQ29983 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MICAQ29983 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MICAQ29983 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MICAQ29983 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MICAQ29983 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MICAQ29983 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MICAQ29983 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
MICAQ29983 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MICAQ29983 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MICAQ29983 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MICAQ29983 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MICAQ29983 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MICAQ29983 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MICAQ29983 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MICAQ29983 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MICAQ29983 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MICAQ29983 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MICAQ29983 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MICAQ29983 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
MICAQ29983 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58 ms