Protein–RNA interactions for Protein: Q16827

PTPRO, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase O, humanhuman

Predictions only

Length 1,216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPROQ16827 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.58
PTPROQ16827 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
PTPROQ16827 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
PTPROQ16827 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
PTPROQ16827 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
PTPROQ16827 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
PTPROQ16827 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PTPROQ16827 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PTPROQ16827 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PTPROQ16827 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PTPROQ16827 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
PTPROQ16827 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PTPROQ16827 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PTPROQ16827 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PTPROQ16827 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PTPROQ16827 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PTPROQ16827 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PTPROQ16827 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PTPROQ16827 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
PTPROQ16827 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
PTPROQ16827 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PTPROQ16827 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PTPROQ16827 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PTPROQ16827 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PTPROQ16827 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PTPROQ16827 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PTPROQ16827 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
PTPROQ16827 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PTPROQ16827 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PTPROQ16827 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PTPROQ16827 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PTPROQ16827 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PTPROQ16827 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PTPROQ16827 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PTPROQ16827 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PTPROQ16827 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PTPROQ16827 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PTPROQ16827 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PTPROQ16827 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PTPROQ16827 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PTPROQ16827 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PTPROQ16827 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PTPROQ16827 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PTPROQ16827 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PTPROQ16827 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
PTPROQ16827 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PTPROQ16827 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PTPROQ16827 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PTPROQ16827 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PTPROQ16827 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PTPROQ16827 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PTPROQ16827 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
PTPROQ16827 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PTPROQ16827 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PTPROQ16827 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PTPROQ16827 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PTPROQ16827 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PTPROQ16827 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PTPROQ16827 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PTPROQ16827 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PTPROQ16827 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PTPROQ16827 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PTPROQ16827 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PTPROQ16827 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PTPROQ16827 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PTPROQ16827 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PTPROQ16827 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PTPROQ16827 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PTPROQ16827 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PTPROQ16827 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PTPROQ16827 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PTPROQ16827 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PTPROQ16827 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PTPROQ16827 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PTPROQ16827 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PTPROQ16827 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PTPROQ16827 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PTPROQ16827 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PTPROQ16827 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PTPROQ16827 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PTPROQ16827 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
PTPROQ16827 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
PTPROQ16827 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PTPROQ16827 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PTPROQ16827 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PTPROQ16827 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
PTPROQ16827 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PTPROQ16827 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PTPROQ16827 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PTPROQ16827 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PTPROQ16827 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PTPROQ16827 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PTPROQ16827 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PTPROQ16827 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PTPROQ16827 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PTPROQ16827 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PTPROQ16827 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PTPROQ16827 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PTPROQ16827 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
PTPROQ16827 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms