Protein–RNA interactions for Protein: Q16619

CTF1, Cardiotrophin-1, humanhuman

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Length 201 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTF1Q16619 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CTF1Q16619 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CTF1Q16619 AKAP7-204ENST00000431975 2954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CTF1Q16619 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CTF1Q16619 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CTF1Q16619 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
CTF1Q16619 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
CTF1Q16619 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CTF1Q16619 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CTF1Q16619 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CTF1Q16619 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CTF1Q16619 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CTF1Q16619 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CTF1Q16619 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CTF1Q16619 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CTF1Q16619 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CTF1Q16619 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CTF1Q16619 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CTF1Q16619 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CTF1Q16619 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
CTF1Q16619 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CTF1Q16619 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CTF1Q16619 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CTF1Q16619 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CTF1Q16619 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CTF1Q16619 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CTF1Q16619 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CTF1Q16619 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CTF1Q16619 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CTF1Q16619 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CTF1Q16619 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
CTF1Q16619 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CTF1Q16619 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CTF1Q16619 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CTF1Q16619 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CTF1Q16619 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CTF1Q16619 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CTF1Q16619 SLC11A2-204ENST00000541174 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CTF1Q16619 PAPOLA-223ENST00000557320 3264 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CTF1Q16619 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CTF1Q16619 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CTF1Q16619 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CTF1Q16619 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CTF1Q16619 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CTF1Q16619 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CTF1Q16619 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CTF1Q16619 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CTF1Q16619 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CTF1Q16619 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CTF1Q16619 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CTF1Q16619 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CTF1Q16619 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CTF1Q16619 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CTF1Q16619 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CTF1Q16619 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
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CTF1Q16619 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CTF1Q16619 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CTF1Q16619 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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CTF1Q16619 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CTF1Q16619 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CTF1Q16619 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CTF1Q16619 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CTF1Q16619 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
CTF1Q16619 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
CTF1Q16619 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
CTF1Q16619 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CTF1Q16619 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CTF1Q16619 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CTF1Q16619 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CTF1Q16619 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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CTF1Q16619 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CTF1Q16619 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
CTF1Q16619 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CTF1Q16619 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CTF1Q16619 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CTF1Q16619 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
CTF1Q16619 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CTF1Q16619 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CTF1Q16619 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CTF1Q16619 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CTF1Q16619 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CTF1Q16619 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CTF1Q16619 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CTF1Q16619 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CTF1Q16619 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
CTF1Q16619 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CTF1Q16619 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CTF1Q16619 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CTF1Q16619 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CTF1Q16619 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CTF1Q16619 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CTF1Q16619 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CTF1Q16619 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CTF1Q16619 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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