Protein–RNA interactions for Protein: Q15012

LAPTM4A, Lysosomal-associated transmembrane protein 4A, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAPTM4AQ15012 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LAPTM4AQ15012 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LAPTM4AQ15012 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LAPTM4AQ15012 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LAPTM4AQ15012 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LAPTM4AQ15012 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LAPTM4AQ15012 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LAPTM4AQ15012 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LAPTM4AQ15012 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LAPTM4AQ15012 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LAPTM4AQ15012 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LAPTM4AQ15012 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LAPTM4AQ15012 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LAPTM4AQ15012 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LAPTM4AQ15012 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LAPTM4AQ15012 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LAPTM4AQ15012 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LAPTM4AQ15012 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LAPTM4AQ15012 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
LAPTM4AQ15012 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
LAPTM4AQ15012 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LAPTM4AQ15012 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LAPTM4AQ15012 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LAPTM4AQ15012 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LAPTM4AQ15012 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LAPTM4AQ15012 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LAPTM4AQ15012 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LAPTM4AQ15012 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LAPTM4AQ15012 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LAPTM4AQ15012 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
LAPTM4AQ15012 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
LAPTM4AQ15012 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LAPTM4AQ15012 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LAPTM4AQ15012 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LAPTM4AQ15012 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LAPTM4AQ15012 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LAPTM4AQ15012 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LAPTM4AQ15012 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LAPTM4AQ15012 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LAPTM4AQ15012 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LAPTM4AQ15012 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LAPTM4AQ15012 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LAPTM4AQ15012 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LAPTM4AQ15012 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
LAPTM4AQ15012 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
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LAPTM4AQ15012 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
LAPTM4AQ15012 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
LAPTM4AQ15012 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LAPTM4AQ15012 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LAPTM4AQ15012 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
LAPTM4AQ15012 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LAPTM4AQ15012 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
LAPTM4AQ15012 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LAPTM4AQ15012 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
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LAPTM4AQ15012 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
LAPTM4AQ15012 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LAPTM4AQ15012 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LAPTM4AQ15012 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
LAPTM4AQ15012 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
LAPTM4AQ15012 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LAPTM4AQ15012 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LAPTM4AQ15012 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
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LAPTM4AQ15012 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
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LAPTM4AQ15012 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
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LAPTM4AQ15012 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LAPTM4AQ15012 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LAPTM4AQ15012 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
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LAPTM4AQ15012 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
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LAPTM4AQ15012 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
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LAPTM4AQ15012 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LAPTM4AQ15012 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
LAPTM4AQ15012 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
LAPTM4AQ15012 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
LAPTM4AQ15012 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
LAPTM4AQ15012 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
LAPTM4AQ15012 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
LAPTM4AQ15012 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
LAPTM4AQ15012 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
LAPTM4AQ15012 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
LAPTM4AQ15012 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
LAPTM4AQ15012 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
LAPTM4AQ15012 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
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