Protein–RNA interactions for Protein: Q08211

DHX9, ATP-dependent RNA helicase A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DHX9Q08211 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
DHX9Q08211 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
DHX9Q08211 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
DHX9Q08211 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
DHX9Q08211 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC17.46■□□□□ 0.39
DHX9Q08211 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
DHX9Q08211 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
DHX9Q08211 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
DHX9Q08211 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
DHX9Q08211 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
DHX9Q08211 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
DHX9Q08211 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
DHX9Q08211 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
DHX9Q08211 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
DHX9Q08211 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
DHX9Q08211 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC17.46■□□□□ 0.39
DHX9Q08211 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
DHX9Q08211 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
DHX9Q08211 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
DHX9Q08211 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
DHX9Q08211 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC17.46■□□□□ 0.38
DHX9Q08211 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
DHX9Q08211 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
DHX9Q08211 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
DHX9Q08211 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
DHX9Q08211 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
DHX9Q08211 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
DHX9Q08211 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
DHX9Q08211 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
DHX9Q08211 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
DHX9Q08211 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
DHX9Q08211 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
DHX9Q08211 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
DHX9Q08211 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
DHX9Q08211 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
DHX9Q08211 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
DHX9Q08211 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
DHX9Q08211 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
DHX9Q08211 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
DHX9Q08211 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
DHX9Q08211 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
DHX9Q08211 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
DHX9Q08211 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
DHX9Q08211 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
DHX9Q08211 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
DHX9Q08211 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
DHX9Q08211 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
DHX9Q08211 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
DHX9Q08211 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
DHX9Q08211 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
DHX9Q08211 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
DHX9Q08211 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
DHX9Q08211 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
DHX9Q08211 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
DHX9Q08211 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
DHX9Q08211 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
DHX9Q08211 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
DHX9Q08211 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
DHX9Q08211 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
DHX9Q08211 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
DHX9Q08211 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
DHX9Q08211 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
DHX9Q08211 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
DHX9Q08211 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
DHX9Q08211 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
DHX9Q08211 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
DHX9Q08211 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
DHX9Q08211 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
DHX9Q08211 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
DHX9Q08211 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
DHX9Q08211 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
DHX9Q08211 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
DHX9Q08211 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
DHX9Q08211 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
DHX9Q08211 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
DHX9Q08211 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
DHX9Q08211 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
DHX9Q08211 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
DHX9Q08211 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
DHX9Q08211 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
DHX9Q08211 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
DHX9Q08211 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
DHX9Q08211 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
DHX9Q08211 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
DHX9Q08211 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
DHX9Q08211 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
DHX9Q08211 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
DHX9Q08211 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
DHX9Q08211 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
DHX9Q08211 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
DHX9Q08211 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
DHX9Q08211 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
DHX9Q08211 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
DHX9Q08211 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
DHX9Q08211 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
DHX9Q08211 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
DHX9Q08211 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
DHX9Q08211 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
DHX9Q08211 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
DHX9Q08211 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.3 ms