Protein–RNA interactions for Protein: Q02556

IRF8, Interferon regulatory factor 8, humanhuman

Predictions only

Length 426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF8Q02556 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
IRF8Q02556 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
IRF8Q02556 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
IRF8Q02556 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
IRF8Q02556 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
IRF8Q02556 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
IRF8Q02556 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
IRF8Q02556 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
IRF8Q02556 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
IRF8Q02556 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
IRF8Q02556 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
IRF8Q02556 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
IRF8Q02556 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
IRF8Q02556 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
IRF8Q02556 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
IRF8Q02556 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
IRF8Q02556 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
IRF8Q02556 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
IRF8Q02556 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
IRF8Q02556 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
IRF8Q02556 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
IRF8Q02556 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
IRF8Q02556 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
IRF8Q02556 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
IRF8Q02556 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
IRF8Q02556 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
IRF8Q02556 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
IRF8Q02556 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
IRF8Q02556 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
IRF8Q02556 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
IRF8Q02556 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
IRF8Q02556 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
IRF8Q02556 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
IRF8Q02556 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
IRF8Q02556 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
IRF8Q02556 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
IRF8Q02556 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
IRF8Q02556 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
IRF8Q02556 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
IRF8Q02556 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
IRF8Q02556 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
IRF8Q02556 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
IRF8Q02556 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
IRF8Q02556 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
IRF8Q02556 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
IRF8Q02556 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
IRF8Q02556 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
IRF8Q02556 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
IRF8Q02556 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
IRF8Q02556 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
IRF8Q02556 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
IRF8Q02556 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
IRF8Q02556 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
IRF8Q02556 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
IRF8Q02556 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
IRF8Q02556 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
IRF8Q02556 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
IRF8Q02556 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
IRF8Q02556 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
IRF8Q02556 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
IRF8Q02556 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
IRF8Q02556 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
IRF8Q02556 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
IRF8Q02556 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
IRF8Q02556 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
IRF8Q02556 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC16.28■□□□□ 0.2
IRF8Q02556 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
IRF8Q02556 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
IRF8Q02556 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
IRF8Q02556 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
IRF8Q02556 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
IRF8Q02556 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
IRF8Q02556 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
IRF8Q02556 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
IRF8Q02556 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
IRF8Q02556 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
IRF8Q02556 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
IRF8Q02556 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
IRF8Q02556 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
IRF8Q02556 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
IRF8Q02556 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
IRF8Q02556 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
IRF8Q02556 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
IRF8Q02556 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
IRF8Q02556 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
IRF8Q02556 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
IRF8Q02556 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
IRF8Q02556 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
IRF8Q02556 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
IRF8Q02556 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
IRF8Q02556 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
IRF8Q02556 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
IRF8Q02556 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
IRF8Q02556 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
IRF8Q02556 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
IRF8Q02556 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
IRF8Q02556 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
IRF8Q02556 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
IRF8Q02556 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
IRF8Q02556 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms