Protein–RNA interactions for Protein: P78414

IRX1, Iroquois-class homeodomain protein IRX-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRX1P78414 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
IRX1P78414 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
IRX1P78414 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
IRX1P78414 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
IRX1P78414 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
IRX1P78414 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
IRX1P78414 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
IRX1P78414 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
IRX1P78414 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
IRX1P78414 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
IRX1P78414 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
IRX1P78414 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
IRX1P78414 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
IRX1P78414 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
IRX1P78414 CTNS-202ENST00000381870 2470 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
IRX1P78414 RUFY1-202ENST00000393438 2454 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
IRX1P78414 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
IRX1P78414 SLC11A2-204ENST00000541174 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
IRX1P78414 LINC00841-201ENST00000451929 2126 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
IRX1P78414 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
IRX1P78414 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
IRX1P78414 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
IRX1P78414 GRB2-203ENST00000392562 3729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
IRX1P78414 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
IRX1P78414 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
IRX1P78414 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
IRX1P78414 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
IRX1P78414 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
IRX1P78414 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
IRX1P78414 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
IRX1P78414 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
IRX1P78414 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
IRX1P78414 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
IRX1P78414 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
IRX1P78414 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
IRX1P78414 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
IRX1P78414 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
IRX1P78414 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
IRX1P78414 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
IRX1P78414 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
IRX1P78414 AGBL3-202ENST00000435976 2495 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
IRX1P78414 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
IRX1P78414 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
IRX1P78414 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
IRX1P78414 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
IRX1P78414 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
IRX1P78414 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
IRX1P78414 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
IRX1P78414 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
IRX1P78414 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
IRX1P78414 GRM7-203ENST00000389336 2901 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
IRX1P78414 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
IRX1P78414 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
IRX1P78414 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
IRX1P78414 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
IRX1P78414 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
IRX1P78414 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
IRX1P78414 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
IRX1P78414 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
IRX1P78414 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
IRX1P78414 JPH4-201ENST00000356300 4278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
IRX1P78414 SYNGAP1-203ENST00000428982 4339 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
IRX1P78414 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
IRX1P78414 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
IRX1P78414 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
IRX1P78414 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
IRX1P78414 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
IRX1P78414 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
IRX1P78414 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
IRX1P78414 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
IRX1P78414 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
IRX1P78414 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
IRX1P78414 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
IRX1P78414 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
IRX1P78414 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
IRX1P78414 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
IRX1P78414 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
IRX1P78414 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
IRX1P78414 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
IRX1P78414 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
IRX1P78414 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
IRX1P78414 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
IRX1P78414 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
IRX1P78414 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
IRX1P78414 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
IRX1P78414 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
IRX1P78414 GPN1-201ENST00000264718 2496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
IRX1P78414 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
IRX1P78414 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
IRX1P78414 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
IRX1P78414 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
IRX1P78414 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
IRX1P78414 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
IRX1P78414 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
IRX1P78414 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
IRX1P78414 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
IRX1P78414 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
IRX1P78414 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
IRX1P78414 AC005899.8-201ENST00000625127 3153 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
IRX1P78414 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.2 ms