Protein–RNA interactions for Protein: P63121

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Pro protein, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P63121 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
HERVK_113P63121 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
HERVK_113P63121 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
HERVK_113P63121 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
HERVK_113P63121 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
HERVK_113P63121 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
HERVK_113P63121 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
HERVK_113P63121 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
HERVK_113P63121 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
HERVK_113P63121 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
HERVK_113P63121 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
HERVK_113P63121 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
HERVK_113P63121 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
HERVK_113P63121 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
HERVK_113P63121 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
HERVK_113P63121 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
HERVK_113P63121 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
HERVK_113P63121 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
HERVK_113P63121 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
HERVK_113P63121 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
HERVK_113P63121 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
HERVK_113P63121 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
HERVK_113P63121 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
HERVK_113P63121 PPM1A-203ENST00000395076 8184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
HERVK_113P63121 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
HERVK_113P63121 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
HERVK_113P63121 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
HERVK_113P63121 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
HERVK_113P63121 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
HERVK_113P63121 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
HERVK_113P63121 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
HERVK_113P63121 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
HERVK_113P63121 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
HERVK_113P63121 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
HERVK_113P63121 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
HERVK_113P63121 PAPOLA-223ENST00000557320 3264 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
HERVK_113P63121 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
HERVK_113P63121 FAM8A1-201ENST00000259963 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
HERVK_113P63121 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
HERVK_113P63121 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
HERVK_113P63121 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
HERVK_113P63121 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
HERVK_113P63121 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
HERVK_113P63121 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
HERVK_113P63121 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
HERVK_113P63121 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
HERVK_113P63121 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
HERVK_113P63121 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
HERVK_113P63121 AL669831.1-201ENST00000506640 6432 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
HERVK_113P63121 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
HERVK_113P63121 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
HERVK_113P63121 AL662899.1-201ENST00000461287 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
HERVK_113P63121 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
HERVK_113P63121 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
HERVK_113P63121 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
HERVK_113P63121 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
HERVK_113P63121 MXD1-206ENST00000540449 5580 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
HERVK_113P63121 SLC35E2B-203ENST00000611123 5948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
HERVK_113P63121 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
HERVK_113P63121 IL17RA-204ENST00000612619 8506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
HERVK_113P63121 COL7A1-201ENST00000328333 9276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
HERVK_113P63121 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
HERVK_113P63121 RTEL1-201ENST00000318100 4676 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
HERVK_113P63121 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
HERVK_113P63121 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
HERVK_113P63121 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
HERVK_113P63121 ITGB2-206ENST00000397852 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
HERVK_113P63121 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
HERVK_113P63121 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
HERVK_113P63121 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
HERVK_113P63121 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
HERVK_113P63121 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
HERVK_113P63121 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
HERVK_113P63121 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
HERVK_113P63121 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
HERVK_113P63121 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
HERVK_113P63121 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
HERVK_113P63121 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
HERVK_113P63121 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
HERVK_113P63121 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
HERVK_113P63121 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
HERVK_113P63121 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
HERVK_113P63121 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
HERVK_113P63121 GLI2-210ENST00000452319 6799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
HERVK_113P63121 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
HERVK_113P63121 LILRP2-201ENST00000413439 2127 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
HERVK_113P63121 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
HERVK_113P63121 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
HERVK_113P63121 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
HERVK_113P63121 EPHX2-207ENST00000521400 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
HERVK_113P63121 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
HERVK_113P63121 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
HERVK_113P63121 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
HERVK_113P63121 SNPH-202ENST00000381873 4995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
HERVK_113P63121 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
HERVK_113P63121 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
HERVK_113P63121 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
HERVK_113P63121 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
HERVK_113P63121 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
HERVK_113P63121 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms