Protein–RNA interactions for Protein: P58499

FAM3B, Protein FAM3B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 235 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3BP58499 MIRLET7BHG-203ENST00000435439 2264 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
FAM3BP58499 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
FAM3BP58499 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
FAM3BP58499 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
FAM3BP58499 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
FAM3BP58499 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
FAM3BP58499 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
FAM3BP58499 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
FAM3BP58499 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
FAM3BP58499 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
FAM3BP58499 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
FAM3BP58499 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
FAM3BP58499 USP36-201ENST00000312010 5234 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
FAM3BP58499 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
FAM3BP58499 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
FAM3BP58499 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
FAM3BP58499 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
FAM3BP58499 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
FAM3BP58499 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
FAM3BP58499 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
FAM3BP58499 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
FAM3BP58499 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
FAM3BP58499 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
FAM3BP58499 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
FAM3BP58499 EFCAB2-202ENST00000366522 6167 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
FAM3BP58499 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
FAM3BP58499 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
FAM3BP58499 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
FAM3BP58499 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
FAM3BP58499 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
FAM3BP58499 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
FAM3BP58499 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
FAM3BP58499 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
FAM3BP58499 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
FAM3BP58499 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
FAM3BP58499 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
FAM3BP58499 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
FAM3BP58499 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC13.15□□□□□ -0.3
FAM3BP58499 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
FAM3BP58499 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC13.15□□□□□ -0.3
FAM3BP58499 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
FAM3BP58499 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
FAM3BP58499 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
FAM3BP58499 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
FAM3BP58499 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC13.15□□□□□ -0.3
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FAM3BP58499 SH2D3C-206ENST00000429553 2794 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
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FAM3BP58499 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
FAM3BP58499 GOPC-203ENST00000535237 4460 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
FAM3BP58499 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
FAM3BP58499 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
FAM3BP58499 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
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FAM3BP58499 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
FAM3BP58499 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
FAM3BP58499 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
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FAM3BP58499 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
FAM3BP58499 ADAM15-204ENST00000359280 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
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FAM3BP58499 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
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FAM3BP58499 LINC01010-201ENST00000431422 2069 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
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FAM3BP58499 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
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FAM3BP58499 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
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FAM3BP58499 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
FAM3BP58499 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
FAM3BP58499 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
FAM3BP58499 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
FAM3BP58499 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
FAM3BP58499 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
FAM3BP58499 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC13.14□□□□□ -0.31
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FAM3BP58499 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
FAM3BP58499 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
FAM3BP58499 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
FAM3BP58499 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
FAM3BP58499 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
FAM3BP58499 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
FAM3BP58499 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
FAM3BP58499 AAK1-202ENST00000409068 2606 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
FAM3BP58499 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
FAM3BP58499 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
FAM3BP58499 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
FAM3BP58499 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
FAM3BP58499 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
FAM3BP58499 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
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