Protein–RNA interactions for Protein: P55291

CDH15, Cadherin-15, humanhuman

Predictions only

Length 814 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH15P55291 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CDH15P55291 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDH15P55291 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDH15P55291 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDH15P55291 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDH15P55291 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDH15P55291 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDH15P55291 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDH15P55291 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDH15P55291 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDH15P55291 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDH15P55291 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDH15P55291 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDH15P55291 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDH15P55291 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDH15P55291 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDH15P55291 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDH15P55291 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDH15P55291 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDH15P55291 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDH15P55291 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDH15P55291 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDH15P55291 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDH15P55291 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDH15P55291 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDH15P55291 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDH15P55291 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDH15P55291 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDH15P55291 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDH15P55291 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CDH15P55291 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDH15P55291 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDH15P55291 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDH15P55291 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDH15P55291 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDH15P55291 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDH15P55291 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDH15P55291 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDH15P55291 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDH15P55291 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CDH15P55291 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDH15P55291 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CDH15P55291 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDH15P55291 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDH15P55291 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDH15P55291 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDH15P55291 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDH15P55291 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDH15P55291 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDH15P55291 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDH15P55291 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDH15P55291 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDH15P55291 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDH15P55291 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDH15P55291 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDH15P55291 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDH15P55291 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDH15P55291 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDH15P55291 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDH15P55291 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDH15P55291 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDH15P55291 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDH15P55291 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDH15P55291 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDH15P55291 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDH15P55291 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDH15P55291 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDH15P55291 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDH15P55291 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CDH15P55291 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDH15P55291 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDH15P55291 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDH15P55291 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDH15P55291 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDH15P55291 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CDH15P55291 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDH15P55291 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CDH15P55291 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDH15P55291 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDH15P55291 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDH15P55291 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDH15P55291 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDH15P55291 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDH15P55291 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDH15P55291 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDH15P55291 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDH15P55291 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDH15P55291 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDH15P55291 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CDH15P55291 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDH15P55291 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDH15P55291 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDH15P55291 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDH15P55291 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDH15P55291 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDH15P55291 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDH15P55291 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDH15P55291 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDH15P55291 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDH15P55291 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.1 ms