Protein–RNA interactions for Protein: P55058

PLTP, Phospholipid transfer protein, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLTPP55058 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
PLTPP55058 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PLTPP55058 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
PLTPP55058 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PLTPP55058 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PLTPP55058 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PLTPP55058 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PLTPP55058 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PLTPP55058 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PLTPP55058 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PLTPP55058 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PLTPP55058 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PLTPP55058 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PLTPP55058 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PLTPP55058 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PLTPP55058 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PLTPP55058 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PLTPP55058 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PLTPP55058 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PLTPP55058 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PLTPP55058 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PLTPP55058 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PLTPP55058 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PLTPP55058 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PLTPP55058 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PLTPP55058 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PLTPP55058 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PLTPP55058 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PLTPP55058 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PLTPP55058 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
PLTPP55058 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PLTPP55058 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PLTPP55058 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PLTPP55058 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PLTPP55058 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PLTPP55058 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PLTPP55058 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PLTPP55058 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PLTPP55058 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PLTPP55058 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PLTPP55058 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PLTPP55058 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PLTPP55058 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PLTPP55058 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PLTPP55058 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PLTPP55058 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PLTPP55058 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PLTPP55058 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PLTPP55058 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PLTPP55058 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PLTPP55058 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PLTPP55058 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
PLTPP55058 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PLTPP55058 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PLTPP55058 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PLTPP55058 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PLTPP55058 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PLTPP55058 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PLTPP55058 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PLTPP55058 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
PLTPP55058 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PLTPP55058 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PLTPP55058 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
PLTPP55058 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PLTPP55058 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PLTPP55058 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PLTPP55058 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PLTPP55058 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PLTPP55058 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PLTPP55058 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PLTPP55058 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PLTPP55058 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PLTPP55058 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PLTPP55058 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PLTPP55058 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
PLTPP55058 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PLTPP55058 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PLTPP55058 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PLTPP55058 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PLTPP55058 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PLTPP55058 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PLTPP55058 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PLTPP55058 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PLTPP55058 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PLTPP55058 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PLTPP55058 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PLTPP55058 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PLTPP55058 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PLTPP55058 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PLTPP55058 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PLTPP55058 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PLTPP55058 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PLTPP55058 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PLTPP55058 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PLTPP55058 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PLTPP55058 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PLTPP55058 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PLTPP55058 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PLTPP55058 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PLTPP55058 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms