Protein–RNA interactions for Protein: P49841

GSK3B, Glycogen synthase kinase-3 beta, humanhuman

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSK3BP49841 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GSK3BP49841 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GSK3BP49841 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GSK3BP49841 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GSK3BP49841 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GSK3BP49841 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GSK3BP49841 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GSK3BP49841 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GSK3BP49841 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
GSK3BP49841 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GSK3BP49841 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GSK3BP49841 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GSK3BP49841 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GSK3BP49841 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GSK3BP49841 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GSK3BP49841 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GSK3BP49841 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GSK3BP49841 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GSK3BP49841 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GSK3BP49841 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GSK3BP49841 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
GSK3BP49841 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GSK3BP49841 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GSK3BP49841 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GSK3BP49841 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GSK3BP49841 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GSK3BP49841 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GSK3BP49841 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GSK3BP49841 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GSK3BP49841 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GSK3BP49841 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GSK3BP49841 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GSK3BP49841 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GSK3BP49841 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GSK3BP49841 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
GSK3BP49841 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GSK3BP49841 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GSK3BP49841 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GSK3BP49841 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GSK3BP49841 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GSK3BP49841 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GSK3BP49841 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
GSK3BP49841 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GSK3BP49841 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GSK3BP49841 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
GSK3BP49841 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GSK3BP49841 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GSK3BP49841 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GSK3BP49841 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GSK3BP49841 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GSK3BP49841 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
GSK3BP49841 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GSK3BP49841 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GSK3BP49841 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GSK3BP49841 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GSK3BP49841 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GSK3BP49841 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GSK3BP49841 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GSK3BP49841 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
GSK3BP49841 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GSK3BP49841 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GSK3BP49841 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GSK3BP49841 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
GSK3BP49841 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GSK3BP49841 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GSK3BP49841 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GSK3BP49841 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
GSK3BP49841 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GSK3BP49841 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GSK3BP49841 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GSK3BP49841 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
GSK3BP49841 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GSK3BP49841 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GSK3BP49841 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GSK3BP49841 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
GSK3BP49841 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GSK3BP49841 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GSK3BP49841 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GSK3BP49841 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GSK3BP49841 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GSK3BP49841 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GSK3BP49841 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GSK3BP49841 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GSK3BP49841 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GSK3BP49841 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GSK3BP49841 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GSK3BP49841 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GSK3BP49841 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GSK3BP49841 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GSK3BP49841 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GSK3BP49841 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
GSK3BP49841 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
GSK3BP49841 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GSK3BP49841 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GSK3BP49841 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GSK3BP49841 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GSK3BP49841 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
GSK3BP49841 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GSK3BP49841 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GSK3BP49841 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms