Protein–RNA interactions for Protein: P49674

CSNK1E, Casein kinase I isoform epsilon, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK1EP49674 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CSNK1EP49674 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CSNK1EP49674 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CSNK1EP49674 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CSNK1EP49674 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CSNK1EP49674 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CSNK1EP49674 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CSNK1EP49674 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CSNK1EP49674 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CSNK1EP49674 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CSNK1EP49674 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CSNK1EP49674 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CSNK1EP49674 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CSNK1EP49674 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CSNK1EP49674 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CSNK1EP49674 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CSNK1EP49674 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CSNK1EP49674 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CSNK1EP49674 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CSNK1EP49674 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CSNK1EP49674 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CSNK1EP49674 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CSNK1EP49674 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CSNK1EP49674 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CSNK1EP49674 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CSNK1EP49674 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CSNK1EP49674 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CSNK1EP49674 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CSNK1EP49674 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CSNK1EP49674 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CSNK1EP49674 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CSNK1EP49674 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CSNK1EP49674 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CSNK1EP49674 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CSNK1EP49674 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CSNK1EP49674 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CSNK1EP49674 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CSNK1EP49674 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CSNK1EP49674 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CSNK1EP49674 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CSNK1EP49674 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CSNK1EP49674 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CSNK1EP49674 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CSNK1EP49674 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CSNK1EP49674 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CSNK1EP49674 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CSNK1EP49674 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CSNK1EP49674 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CSNK1EP49674 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CSNK1EP49674 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CSNK1EP49674 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CSNK1EP49674 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CSNK1EP49674 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CSNK1EP49674 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CSNK1EP49674 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CSNK1EP49674 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CSNK1EP49674 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CSNK1EP49674 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CSNK1EP49674 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CSNK1EP49674 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CSNK1EP49674 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CSNK1EP49674 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CSNK1EP49674 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CSNK1EP49674 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CSNK1EP49674 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CSNK1EP49674 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CSNK1EP49674 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CSNK1EP49674 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CSNK1EP49674 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CSNK1EP49674 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CSNK1EP49674 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CSNK1EP49674 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CSNK1EP49674 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CSNK1EP49674 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CSNK1EP49674 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CSNK1EP49674 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CSNK1EP49674 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CSNK1EP49674 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CSNK1EP49674 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CSNK1EP49674 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CSNK1EP49674 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CSNK1EP49674 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CSNK1EP49674 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CSNK1EP49674 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CSNK1EP49674 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CSNK1EP49674 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CSNK1EP49674 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CSNK1EP49674 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CSNK1EP49674 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CSNK1EP49674 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CSNK1EP49674 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CSNK1EP49674 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CSNK1EP49674 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CSNK1EP49674 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CSNK1EP49674 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CSNK1EP49674 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CSNK1EP49674 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CSNK1EP49674 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CSNK1EP49674 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CSNK1EP49674 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50 ms