Protein–RNA interactions for Protein: O60931

CTNS, Cystinosin, humanhuman

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNSO60931 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CTNSO60931 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CTNSO60931 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CTNSO60931 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CTNSO60931 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CTNSO60931 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CTNSO60931 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CTNSO60931 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CTNSO60931 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CTNSO60931 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CTNSO60931 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CTNSO60931 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CTNSO60931 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CTNSO60931 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CTNSO60931 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CTNSO60931 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CTNSO60931 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CTNSO60931 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CTNSO60931 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CTNSO60931 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CTNSO60931 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CTNSO60931 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CTNSO60931 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CTNSO60931 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CTNSO60931 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CTNSO60931 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CTNSO60931 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CTNSO60931 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CTNSO60931 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CTNSO60931 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CTNSO60931 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CTNSO60931 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CTNSO60931 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CTNSO60931 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CTNSO60931 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CTNSO60931 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CTNSO60931 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CTNSO60931 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CTNSO60931 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CTNSO60931 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CTNSO60931 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CTNSO60931 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CTNSO60931 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CTNSO60931 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CTNSO60931 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CTNSO60931 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CTNSO60931 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CTNSO60931 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CTNSO60931 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CTNSO60931 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CTNSO60931 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CTNSO60931 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CTNSO60931 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CTNSO60931 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CTNSO60931 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CTNSO60931 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CTNSO60931 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CTNSO60931 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CTNSO60931 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CTNSO60931 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CTNSO60931 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CTNSO60931 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CTNSO60931 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CTNSO60931 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CTNSO60931 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CTNSO60931 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CTNSO60931 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CTNSO60931 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CTNSO60931 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
CTNSO60931 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CTNSO60931 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CTNSO60931 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CTNSO60931 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CTNSO60931 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
CTNSO60931 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CTNSO60931 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CTNSO60931 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CTNSO60931 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CTNSO60931 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CTNSO60931 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CTNSO60931 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CTNSO60931 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CTNSO60931 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CTNSO60931 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
CTNSO60931 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CTNSO60931 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CTNSO60931 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CTNSO60931 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CTNSO60931 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CTNSO60931 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CTNSO60931 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CTNSO60931 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
CTNSO60931 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
CTNSO60931 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
CTNSO60931 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
CTNSO60931 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
CTNSO60931 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC15.71■□□□□ 0.1
CTNSO60931 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
CTNSO60931 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
CTNSO60931 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms