Protein–RNA interactions for Protein: O43924

PDE6D, Retinal rod rhodopsin-sensitive cGMP 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit delta, humanhuman

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Length 150 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE6DO43924 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
PDE6DO43924 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PDE6DO43924 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PDE6DO43924 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PDE6DO43924 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PDE6DO43924 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PDE6DO43924 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PDE6DO43924 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PDE6DO43924 C3-201ENST00000245907 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PDE6DO43924 NDFIP2-201ENST00000218652 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PDE6DO43924 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PDE6DO43924 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PDE6DO43924 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PDE6DO43924 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PDE6DO43924 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PDE6DO43924 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PDE6DO43924 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PDE6DO43924 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
PDE6DO43924 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PDE6DO43924 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
PDE6DO43924 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PDE6DO43924 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PDE6DO43924 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
PDE6DO43924 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PDE6DO43924 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PDE6DO43924 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PDE6DO43924 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
PDE6DO43924 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PDE6DO43924 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
PDE6DO43924 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PDE6DO43924 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PDE6DO43924 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PDE6DO43924 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PDE6DO43924 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PDE6DO43924 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PDE6DO43924 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PDE6DO43924 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PDE6DO43924 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PDE6DO43924 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PDE6DO43924 NWD2-201ENST00000309447 8325 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PDE6DO43924 SDK1-210ENST00000615806 10258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PDE6DO43924 USP19-205ENST00000398898 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PDE6DO43924 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PDE6DO43924 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PDE6DO43924 SPATA6-204ENST00000396199 4964 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PDE6DO43924 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PDE6DO43924 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PDE6DO43924 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PDE6DO43924 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PDE6DO43924 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PDE6DO43924 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PDE6DO43924 ITPRIPL2-201ENST00000381440 7247 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PDE6DO43924 KIF1A-201ENST00000320389 8832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PDE6DO43924 CAMK2D-205ENST00000394524 5294 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PDE6DO43924 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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PDE6DO43924 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PDE6DO43924 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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PDE6DO43924 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PDE6DO43924 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PDE6DO43924 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PDE6DO43924 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PDE6DO43924 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PDE6DO43924 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
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PDE6DO43924 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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PDE6DO43924 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PDE6DO43924 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
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PDE6DO43924 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
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PDE6DO43924 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
PDE6DO43924 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PDE6DO43924 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PDE6DO43924 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PDE6DO43924 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
PDE6DO43924 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
PDE6DO43924 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PDE6DO43924 CEP170B-204ENST00000556508 6683 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PDE6DO43924 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PDE6DO43924 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PDE6DO43924 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PDE6DO43924 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PDE6DO43924 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PDE6DO43924 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PDE6DO43924 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PDE6DO43924 MINDY2-203ENST00000559228 9238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PDE6DO43924 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PDE6DO43924 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PDE6DO43924 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PDE6DO43924 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PDE6DO43924 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PDE6DO43924 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PDE6DO43924 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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